껌딱지같은 녀석이 되어버렸습니다.
다양한 정보를 가지고있기는 한데 그 안에서 정보를 추출같은 핸들링하기가 쉽지 않은게 사실이긴 합니다.
그래서 여기 sam파일 bam파일을 samtools보다 빠르게 처리해주는 툴하나
가지고 와봤습니다.
모 이미 samtools대신에 잘 사용하고 계실겁니다.
sambamba라고 (현재 버전은 v0.7.0 입니다. 논문은 여기에 있습니다.)
sambamba는 samtools와 비슷한 대부분의 기능을 가지고 있습니다.
view, sort, index, merge, slice, flagstat, markdup
그리고 사용법도 모 크게 어렵지 않습니다. :)
sambamba documentation을 보시면 모 크게 어렵지 않게 손쉽게 사용하실 수 있을겁니다. :)
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| 출처: sana_twice.09 |
