엑셀에서 확인하는 CV

출처: Silphion System


통계작업은 보통 R을 쓰지만 급작스럽게 간단한 수치를 확인할 때는
나도 그렇고 독자도 그렇겠거니와 굳이 R 켜서 명령어 날리기 귀찮다.
(역시 나만 귀찮은거였어 그런거였어.. ㅠ.ㅜ)

그래서 엑셀을 많이 사용하는데

요즘 자주 보는 변동계수, CV (Coefficient of Variability)
자료가 얼마나 흝어져 있냐 아니냐를 판단해주는 값

엑셀에서 CV구하는 식은 다음과 같다.
=STDEV(범위)/AVERAGE(범위)x100

그럼 짠하고 나온다는 말씀.. :)

CD-HIT 사용하기

CD-HIT
site: cd-hit site

초간단하게 말하자면
서열들끼리 alignment해서 서로 겹쳐지는 서열이면
제일 긴 서열을 대표로 해서 중복되는 서열 제거하자 이런 거..

근데 -T 옵션을 사용해서 여러 thread를 사용할 수 있는데
"multi-threading with OpenMP is NOT Enable!!"
이라는 안내문구가 나오고 single cpu로만 된다는....

그래서 왜 그렇지 하고 OpneMP가 설치안됐나?했지만
역시나 잘 설치되어있고..

결론은 make할때 openmp=yes 하며 된다는.. :)