bam파일을 가장 쌈빡하게 잘 다루는 방법

NGS 시대를 살면서 bam파일은 어떻게 땔래야 땔수없는
껌딱지같은 녀석이 되어버렸습니다.

다양한 정보를 가지고있기는 한데 그 안에서 정보를 추출같은 핸들링하기가 쉽지 않은게 사실이긴 합니다.

그래서 여기 sam파일 bam파일을 samtools보다 빠르게  처리해주는 툴하나
가지고 와봤습니다.

모 이미 samtools대신에 잘 사용하고 계실겁니다.

sambamba라고 (현재 버전은 v0.7.0 입니다. 논문은 여기에 있습니다.)

sambamba는 samtools와 비슷한 대부분의 기능을 가지고 있습니다.
view, sort, index, merge, slice, flagstat, markdup
그리고 사용법도 모 크게 어렵지 않습니다. :)

sambamba documentation을 보시면 모 크게 어렵지 않게 손쉽게 사용하실 수 있을겁니다. :)

출처: sana_twice.09