이제부터는 ConsensusPrime을 사용해보자.
ConsensusPrime—A Bioinformatic Pipeline for Ideal Consensus Primer Design
https://github.com/mcollatz/ConsensusPrime
작년 말에 출판된 논문으로 서열 정렬과 프라이머 디자인까지 자동화한 tool 소개 곰국되겠습니다.
소스코드는 물론 최신 트렌드에 맞게 docker로도 제공되고있습니다.
primer를 디자인 하고자 하는 영역의 서열과 primer3의 paramerter 파일만 준비하면 나머지는 제가, 아니 ConsensusPrime가 해줍니다.
물론 내가 원하는 수준의 결과물이 나오냐? 그런 모르겠습니다만
그래도 온갖 삽질은 줄어 들것 같은 긍정회로가 돌아가고 있지 않나요?
실제로 쓸만한지는 한번 사용해보는걸로 :)
다음에 흥미로운 논문으로 찾아오도록 하겠습니다.
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| @ye._.vely618 |
