mummer에서 larger than maximal textlen에러가 발생한다면

MUMmer3를 사용해서 작업하다가 

textlen에러를 맞이할 경우가 사실 생각보다 많이 있으리라고는 생각하지 않지만

그래도 이런 문제가 발생하였을 때 어떻게 대체해야 하는지

이미 수년전에 어느 용자께서 이에 대한 해답을 정리하셨었습니다.!!

>여기<

한글로 풀어쓰자면

1. MUMmer3.23/src/kurtz/libbasedir/types.h에 "#define SIXTYFOURBITS” 행을 “#ifdef SIXTYFOURBITS"이 행앞에 추가 하기

#define SIXTYFOURBITS
#ifdef SIXTYFOURBITS

2. 그리고 make할때 다음과 같이 하기

make clean

make CPPFLAGS=”-O3 -DSIXTYFOURBITS”

그럼 마법과 같이 MUMmer3 구동시 에러가 발생하지 않습니다.

출처 : @ye._.vely618

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CD-HIT
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초간단하게 말하자면
서열들끼리 alignment해서 서로 겹쳐지는 서열이면
제일 긴 서열을 대표로 해서 중복되는 서열 제거하자 이런 거..

근데 -T 옵션을 사용해서 여러 thread를 사용할 수 있는데
"multi-threading with OpenMP is NOT Enable!!"
이라는 안내문구가 나오고 single cpu로만 된다는....

그래서 왜 그렇지 하고 OpneMP가 설치안됐나?했지만
역시나 잘 설치되어있고..

결론은 make할때 openmp=yes 하며 된다는.. :)