토요일, 5월 30, 2020

Entrez를 이용한 fasta 파일 다운받기

간만에 Biopython에 포함되어 있는 Entrez 함수를 이용하여 assceesion넘버로 fasta파일 다운받기를 해봤습니다.

git: https://github.com/gwlee/study/blob/master/entrez_access2fasta.py


python entrez_access2fasta.py accessionid 하면 {accessionid}.fasta파일이 생성됩니다.

참 쉽죠?

Biopython만 잘 사용하셔도 갱장한 것들을 하실 수 있으시고
그런 의미에서 다음번에는 좀더 재미진 내용으로 찾아오도록 하겠습니다. :)








출처: @sana_twice.09
출처: @sana_twice.09



댓글 1개:

익명 :
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