Microbiome Database를 만들어볼까? -ChunLab편-

간만에 Microbiome DB 관련 글을 올립니다!
그래봤자 또 다운로드하자 되겠습니다. :)

오늘은 국내 microbiom 기업중 가장 기술력을 가지고 있는
업체인 chunlab의 DB 되겠습니다.

이 DB의 경우 당연히 fee를 내셔야합니다.

라이센스를 정확히 안읽어봤는데..
비영리면 무료였나? 정확하진 않지만
무엇인가 영리 서비스 하고자 EzBioCloud 16S database를 사용하려면
fee를 내야합니다.

다운로드는 다음 링크에 가셔서 다운로드 받으시면 됩니다.

>이곳<

천랩의 DB의 경우 제가 사용하겠다 말겠다할수 있는건 아니라서..
다운로드 받고싶으신 분들만 받아서 잘 사용하시면 되겠습니다.
qiime으로 분석하시는 분들께서는 별 무리없이 사용하시는 파이프라인에 붙여서 사용하실 수 있게 제작되었습니다. 사실 그냥 작동합니다. :)

출처: SM

EzBioCloud 16S DB 관련

천종식교수님께서 CEO로 있으신 천랩에서
ezbiocloud를 개편하면서  16S db도 오픈을 해서
다운로드받아 사용할 수 있게 해주신건 이미 알고 계시죠!

다만 그 가운데 taxonomy.txt 파일에 level이 kingdom마다 상이한게 있어서
천랩에 수정요청을 드렸고 수정됐다고 합니다.

분석 자체에는 당근 문제가 없지만
추후에 결과 display할때 예외처리 같은거 해줘야 하는 수고가 있는 관계로
수정을 부탁드렸었습니다.

아마 이제 받으시는 데이터는 level 7인 데이터로 받을 수 있지 않을까 합니다. :)