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수요일, 7월 16, 2025

우리 몸속의 친구들이 만들어내는 건강에 도움되는 것들에 대해서

오늘은 마이크로바이옴논문을 소개하도록 하겠습니다. 우리 몸속에 수많은 미생물들이 존재합니다. 일부는 식별하고 있기도 하지만 일부는 아직도 모르고 지가가고 있고 많이 있습니다. 미생물이 있는 영역을 자연으로 확대한다면 우리는 아직 모르고 있다 라고 하는것이 더 적절할것입니다. 그런 의미에서 인류의 건강증진을 위해서 우리 몸속에 있는 친구들을 잘 이용하면 좋을텐데 그냥 우리가 잘 모르니깐 알아보자보다는 이런 좋은 점이 있으니 알아보자가 더 좋지 않을까합니다. 

그래서 오늘 논문은 우리 몸속에 있는 작은 친구들이 만들어내는게 우리 건강에 좋다는 것에 대해서 알아보고 새로운 대사산물이나 신약개발에 도움을 받을 수 있는 것들이 없는지 확인해보자라는 내용 되겠습니다. 제목은 Exploring the bioactive landscape: peptides and non-peptides from the human microbiota 되겠습니다.

DOI: 10.1038/s41522-025-00713-x


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인간 마이크로바이옴은 다양한 생리적 시스템에 영향을 미치며, 여기서 생산되는 대사산물은 의약품 및 생명공학에 중요한 역할을 합니다. 이 연구는 인간 마이크로바이옴에서 유래한 펩타이드와 비펩타이드 대사산물의 구조와 기능을 탐구하여 새로운 대사산물 발견과 약물 개발을 촉진하고자 합니다.

1. **인간 마이크로바이옴의 구성**

   - 인간 마이크로바이옴은 박테리아, 효모, 바이러스로 구성되며, 주로 Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacteria 등의 phyla에 속합니다.

   - 마이크로바이옴은 소화계, 생식계, 호흡계, 피부 등 여러 기관에 존재하며, 신체 기능에 중요한 역할을 합니다.

2. **마이크로바이옴의 대사산물**

   - 마이크로바이옴은 항균 활성을 가진 펩타이드와 비펩타이드 대사산물을 생산하며, 이는 질병과 관련된 생물학적 과정에 영향을 미칩니다.

   - 이러한 대사산물은 개인화된 진단과 치료 전략에 필수적인 요소로 부상하고 있습니다.

3. **연구의 의의**

   - 마이크로바이옴의 대사산물 연구는 새로운 대사산물 발견과 약물 개발을 촉진하며,Precision Medicine의 발전에 기여합니다.

   - 다양한 오믹스 기술과 문화유전체학을 통해 마이크로바이옴 대사산물의 연구가 더욱 심화되고 있습니다.



업로드한 논문을 블로그용으로 요약하고 싶어요.
논문 제목: Exploring the bioactive landscape: peptides and non-peptides from the human microbiota
대상 독자: 생명과학을 전공하지 않은 일반 성인 독자
A4용지 두 장 이내로 연구 배경, 목적, 방법, 결과, 고찰, 의의와 시사점까지 포함해서 쉽게 써 주세요. 마지막에는 이 연구가 왜 중요한지도 덧붙여 주세요

chatGPT

다음은 논문 \*\*"Exploring the bioactive landscape: peptides and non-peptides from the human microbiota"\*\*를 생명과학 비전공 일반 성인 독자도 이해할 수 있도록 쉽게 요약한 블로그용 글입니다. A4용지 두 장 이내로 구성하였으며, 연구의 배경부터 시사점까지 포함하였습니다.

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### 우리 몸속 미생물의 숨은 힘: 건강을 지키는 미세한 화학물질들

#### 🧬 연구 배경

우리 몸에는 수십 조 개의 미생물이 살고 있습니다. 이들을 **‘마이크로바이오타(microbiota)’**, 또는 **장내세균총**이라고 부르죠. 장뿐 아니라 입, 피부, 생식기 등 온몸에 퍼져 있으며, 소화부터 면역, 심지어 뇌 기능까지 다양한 생리작용에 영향을 줍니다.

최근에는 이 미생물들이 단순히 사는 것에 그치지 않고, 우리 건강에 중요한 \*\*생리활성물질(bioactive metabolites)\*\*을 만들어낸다는 사실이 밝혀지고 있습니다. 이 물질들은 항생제처럼 병원균을 억제하거나 면역을 조절하는 데 중요한 역할을 합니다.

#### 🔍 연구 목적

이 논문은 사람 몸에 사는 미생물들이 만들어내는 \*\*펩타이드(단백질 조각)\*\*와 **비펩타이드(지질, 산 등 기타 화합물)** 성분을 체계적으로 정리하고, 이들이 어떤 작용을 하는지 살펴보는 리뷰 논문입니다. 특히 질병 치료에 응용할 수 있는 가능성을 모색하는 데 중점을 두었습니다.

#### 🧪 연구 방법

* 기존 문헌, 데이터베이스, 분석 툴을 활용해 **미생물 유래 물질**들을 정리

* 최신 **유전체 분석** 및 **화학적 구조 예측** 기법들을 통해 어떤 세균이 어떤 물질을 만드는지 파악

* 펩타이드와 비펩타이드를 각각 나누어 비교 분석

#### 📊 주요 결과 요약

1. **주요 미생물 군집**

   * **Firmicutes**와 **Bacteroidetes**가 장내 미생물의 90%를 차지

   * 각각의 미생물은 특정 화합물들을 생산하며, 그 기능도 다름

2. **비펩타이드 물질**

   * 예: \*\*락토바실러스(Lactobacillus)\*\*가 만드는 'Reuterin'은 유해 세균 억제에 효과

   * **Bacteroides**가 만드는 \*\*스핑고지질(sphingolipid)\*\*은 면역조절과 관련

3. **펩타이드 물질**

   * 대표적으로 **Nisin**이라는 천연 항생제가 있으며, 식품 보존제로도 사용됨

   * **Gassericin**, **Plantaricin** 등도 항균 활성이 뛰어남

4. \*\*미생물 불균형(디스바이오시스)\*\*이 문제를 유발할 수 있음

   * 좋은 물질은 줄고, 해로운 물질이 늘어 여러 질병과 연관

#### 💡 고찰과 시사점

* \*\*개인 맞춤형 의학(정밀의학)\*\*에서 미생물 유래 물질은 매우 유망한 자원입니다.

* 항생제 내성이 커지는 상황에서, 자연 유래의 **새로운 항균제 개발**이 절실한데, 미생물이 그 해답이 될 수 있습니다.

* 그러나 아직도 많은 미생물과 물질이 **미지의 영역**에 머물러 있어, 이를 밝히기 위한 **다중오믹스(유전체+대사체+단백질체 등)** 기술의 발전이 필요합니다.

#### ✅ 이 연구의 중요성

이 논문은 단순히 “우리 몸에 미생물이 많다”는 수준을 넘어서, **그들이 만들어내는 물질 하나하나가 인체에 어떤 영향을 미치는지**를 본격적으로 다루고 있다는 점에서 의미가 있습니다. 특히 펩타이드와 비펩타이드라는 두 가지 분자군을 동시에 포괄적으로 분석한 최초의 정리 중 하나입니다.

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### ✨ 마무리: 왜 중요한가요?

앞으로의 의학은 개개인의 미생물 환경까지 고려하는 시대가 될 것입니다. 이 연구는 **우리 몸속 미생물이 만들어내는 물질이 치료제의 원천이 될 수 있다**는 가능성을 보여줍니다. 지금까지 주목받지 못했던 **장내 세균의 화학공장**이, 미래에는 암, 염증, 감염병 치료의 핵심이 될지도 모릅니다.


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우리 몸속 미생물이 만드는 놀라운 물질들: 건강과 약 개발의 열쇠

연구 배경

우리 몸에는 수조 개의 미생물이 살고 있어요. 이 미생물들은 장, 입, 피부 등 여러 곳에서 각자의 역할을 하며 우리 건강에 큰 영향을 미칩니다. 이 미생물들은 단백질(펩타이드)과 비단백질(비펩타이드) 형태의 물질을 만들어내는데, 이 물질들은 항균 효과를 비롯해 다양한 생물학적 기능을 가지고 있어요. 이런 물질들은 질병 치료나 새로운 약 개발에 큰 가능성을 가지고 있지만, 아직 우리가 아는 것은 빙산의 일각일 뿐입니다.

연구 목적

이 논문은 우리 몸속 미생물이 만드는 펩타이드와 비펩타이드 물질의 구조와 기능을 탐구하는 것을 목표로 해요. 이를 통해 새로운 물질을 발견하고, 이를 이용해 질병 치료나 건강 증진에 기여할 수 있는 약을 개발하려는 것이죠. 특히, 이 물질들이 어떻게 항균 작용을 하고, 어떤 질병과 관련이 있는지를 이해하려고 했습니다.

연구 방법

연구팀은 다양한 미생물(특히 Firmicutes, Bacteroidetes 같은 주요 미생물군)에서 나오는 물질들을 조사했어요. 이들은 문헌을 검토하고, 실험 데이터를 분석하며, 미생물이 만드는 물질의 화학적 구조와 생물학적 효과를 정리했습니다. 예를 들어, 락토바실러스(Lactobacillus) 같은 유익한 미생물이 만드는 물질(예: 락토바실러스 루테리에서 나오는 뤼테린)과 그 효과를 자세히 들여다봤죠. 또한, 이 물질들이 어떻게 병원성 세균을 억제하거나 건강을 돕는지 확인했습니다.

연구 결과

연구 결과, 미생물이 만드는 물질은 매우 다양했어요. 예를 들어:

뤼테린(Reuterin): 락토바실러스 루테리가 만드는 이 물질은 유해 세균의 성장을 막고, 면역 체계를 강화해요.

니신(Nisin): 락토코커스 락티스에서 나오는 항균 펩타이드로, 식품 보존제로도 사용되며 병원균을 억제합니다.

뮤타노박틴(Mutanobactin): 스트렙토코커스 뮤탄스가 만들며, 곰팡이 성장을 억제해 구강 건강에 도움을 줍니다.이 외에도 여러 미생물이 만드는 물질들이 항균, 항암, 장 건강 개선 등 다양한 효과를 가진 것으로 나타났어요. 특히, 이런 물질들은 기존 항생제에 내성이 생긴 세균을 다루는 데도 유용할 가능성이 보였습니다.

고찰

이 연구는 미생물이 만드는 물질들이 단순히 항균 효과를 넘어 다양한 생리적 기능을 한다는 점을 보여줍니다. 하지만 아직 이 물질들의 작용 메커니즘이나 장기적인 효과는 충분히 밝혀지지 않았어요. 예를 들어, 뤼테린은 항균 효과가 뛰어나지만, 대량 생산이나 인체 내 안정성에 대한 추가 연구가 필요합니다. 또한, 미생물군의 균형이 깨지면(예: 잘못된 식습관이나 스트레스로) 이 물질들의 생산이 달라질 수 있어요. 이는 건강 문제로 이어질 수 있죠.

의의와 시사점

이 연구는 미생물이 단순한 "세균"이 아니라 우리 몸의 건강을 지키는 중요한 파트너라는 점을 강조해요. 이들이 만드는 물질은 새로운 항생제, 면역 강화제, 심지어 암 치료제 개발의 단서가 될 수 있습니다. 특히, 항생제 내성이 전 세계적인 문제로 떠오른 지금, 미생물에서 나온 천연 물질은 기존 약을 대체할 수 있는 대안이 될 수 있어요. 또한, 이 연구는 개인 맞춤형 프로바이오틱스(유익한 미생물 보충제) 개발로 이어질 수 있어, 개인의 건강 상태에 맞는 치료법을 설계하는 데 기여할 가능성이 큽니다.

이 연구가 왜 중요한가?

이 연구는 우리 몸속 미생물이 단순히 "공존"하는 존재가 아니라, 건강과 질병 치료에 혁신을 가져올 수 있는 보물창고라는 점을 보여줍니다. 항생제 내성 같은 현대 의학의 난제를 해결할 새로운 물질을 찾는 데 중요한 단서를 제공하며, 더 건강한 삶을 위해 미생물과 우리의 관계를 재조명합니다. 이 연구를 통해 우리는 식습관, 생활 방식, 환경이 미생물 건강에 얼마나 중요한지 깨닫고, 이를 관리하는 것이 곧 우리의 건강을 지키는 길임을 알 수 있어요.


perplexity.ai

## 인간 미생물군이 만드는 생체활성 물질: 우리 몸에 숨겨진 약의 보고

### **연구 배경**

우리 몸에는 수십조 개의 미생물이 살고 있습니다. 이들은 장, 피부, 입, 생식기 등 다양한 부위에 자리를 잡고 있으며, 건강 유지에 매우 중요한 역할을 합니다. 최근 연구에 따르면 이 미생물군(마이크로바이옴)은 소화, 면역, 신경계, 대사 등 다양한 생리 작용에 영향을 미치며, 알츠하이머 같은 뇌 질환이나 비만, 당뇨, 자가면역질환 등 여러 질병과도 밀접하게 연관되어 있다는 사실이 밝혀지고 있습니다[1].

### **연구 목적**

이 논문은 인간 미생물군이 만들어내는 생체활성 물질, 즉 펩타이드(짧은 단백질 조각)와 비펩타이드(지방산, 비타민, 폴리케타이드 등) 대사산물에 주목합니다. 이 물질들이 우리 건강에 어떤 영향을 미치는지, 그리고 이들이 새로운 약 개발에 어떻게 활용될 수 있는지를 체계적으로 정리하고자 했습니다[1].

### **연구 방법**

연구진은 다양한 과학 논문 데이터베이스(Google Scholar, PubMed, Web of Science 등)를 통해 최신 연구 결과를 수집했습니다. 미생물군이 만드는 대사산물의 구조와 기능, 그리고 이들이 인체에 미치는 영향을 분석하고, 최신 유전체 분석 및 컴퓨터 예측 기술(예: antiSMASH, PRISM4, DeepRiPP 등)을 활용해 어떤 미생물이 어떤 물질을 만드는지까지 추적했습니다[1].

### **주요 결과**

- **미생물군의 다양성**  

  인간 미생물군은 Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria, Proteobacteria 등 6개 주요 문(phyla)으로 구성되어 있습니다. 이 중 Firmicutes와 Bacteroidetes가 전체의 약 90%를 차지합니다. 각 미생물군은 서로 다른 대사산물을 만들어냅니다[1].

- **생체활성 펩타이드와 비펩타이드**  

  - *펩타이드*: 주로 항균 작용을 하며, 우리 몸을 병원균으로부터 보호합니다.

  - *비펩타이드*: 지방산(특히 단쇄지방산), 비타민, 폴리케타이드 등 다양하며, 대사 조절, 면역 강화, 염증 억제 등 여러 기능을 합니다[1].

- **대표적 예시**

  - *Lactobacillus reuteri*가 만드는 ‘리우테린’(Reuterin)은 해로운 박테리아만 선택적으로 억제하는 강력한 항균 물질입니다.

  - *Streptococcus mutans*가 만드는 ‘뮤타노사이클린’(Mutanocyclin)은 구강 내 곰팡이(칸디다)에 강한 항진균 효과를 보입니다.

  - *Bifidobacterium* 등은 비타민과 단쇄지방산을 만들어 장 건강과 면역에 기여합니다[1].

- **질병과의 연관성**  

  미생물군의 불균형(디스바이오시스)이 생기면 유익한 대사산물은 줄고, 해로운 물질이 늘어나 각종 질환(염증성 장질환, 비만, 대사질환 등)에 영향을 미칩니다[1].

### **고찰 및 의의**

- **맞춤 의학의 가능성**  

  미생물군이 만드는 대사산물은 질병의 바이오마커(진단 지표)나 치료 타깃으로 활용될 수 있습니다. 개인별 미생물군 분석을 통해 맞춤형 치료와 예방 전략을 세울 수 있습니다[1].

- **새로운 약물 개발**  

  기존 항생제의 남용으로 내성이 커지는 상황에서, 미생물군이 만드는 새로운 항균·항염증 물질은 미래 신약 개발의 중요한 자원이 될 수 있습니다[1].

- **미지의 영역**  

  아직 연구되지 않은 미생물과 대사산물이 많아, 앞으로 다양한 질병 치료와 건강 증진에 활용될 가능성이 큽니다[1].

### **이 연구의 중요성**

이 논문은 인간 미생물군이 만들어내는 다양한 생체활성 물질의 구조와 기능, 그리고 이들이 인체 건강에 미치는 영향을 종합적으로 정리했습니다. 이는 단순히 미생물군의 역할을 넘어서, 미래의 맞춤 의학과 신약 개발, 질병 예방 및 치료 전략에 큰 전환점을 제공할 수 있습니다. 즉, 우리 몸속 미생물군이 ‘숨겨진 약의 보고’임을 보여주며, 앞으로 이 분야의 연구가 더욱 활발히 이루어져야 함을 시사합니다[1].

Citations:

[1] https://ppl-ai-file-upload.s3.amazonaws.com/web/direct-files/attachments/40912948/3171e71e-5a41-4d7b-9ce1-c5327d1afca8/s41522-025-00713-x.pdf

[2] https://www.nature.com/articles/s41522-025-00713-x

[3] https://www.nature.com/articles/s41467-025-58280-w

[4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40341751/

[5] https://colab.ws/articles/10.1038%2Fs41522-025-00713-x

[6] https://www.nature.com/npjbiofilms/articles?type=review&year=2025

[7] https://www.sciencedirect.com/org/science/article/pii/S0265056824000813

[8] https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2025/md/d4md00383g

[9] https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2212429224022119



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## 인체 마이크로바이옴의 신비로운 물질들: 펩타이드와 비펩타이드를 파헤치다

우리의 몸은 혼자서는 살아갈 수 없습니다. 눈에 보이지 않는 수많은 미생물들이 우리 몸 곳곳에 살면서 다양한 역할을 수행하고 있기 때문이죠. 이러한 미생물 공동체를 **인체 마이크로바이옴**이라고 부릅니다. 주로 박테리아로 이루어져 있지만, 효모나 바이러스 등 다양한 종류의 미생물이 포함되어 있습니다.

마이크로바이옴은 소화기관, 생식기관, 구강, 피부 등 우리 몸의 여러 부위에 살면서 해당 기관의 기능은 물론, 신경계, 내분비계, 대사계, 면역계 등 우리 몸 전체의 생리적 과정에 중요한 영향을 미칩니다. 심지어 마이크로바이옴이 가진 유전 정보는 인간 유전체보다 훨씬 많아, 하나의 중요한 장기로 여겨지기도 합니다.

그런데 이 마이크로바이옴이 단순히 우리 몸에 살기만 하는 것이 아니라, 다양한 **생리 활성 물질(bioactive metabolites)**을 만들어낸다는 사실을 알고 계신가요? 이 물질들은 우리 건강에 이롭거나 해로운 영향을 미치기도 하며, 질병과도 깊은 관련이 있습니다. 하지만 이 신비로운 물질들의 구조와 기능에 대해서는 아직 알려지지 않은 부분이 많습니다.

이 연구 논문은 바로 이 인체 마이크로바이옴이 생산하는 생리 활성 물질들, 특히 **펩타이드(peptides)**와 **비펩타이드(non-peptides)** 물질에 대해 탐구하고 있습니다.

### 연구 배경 및 목적

오랫동안 과학자들은 마이크로바이옴이 항균 작용을 하는 펩타이드 물질을 생산한다는 것을 알고 있었습니다. 하지만 펩타이드 외의 다른 비펩타이드 물질들도 우리 건강에 중요한 역할을 한다는 점이 점차 밝혀지고 있습니다. 또한, 마이크로바이옴의 균형이 깨지는 현상(**dysbiosis**)은 다양한 질병의 원인이 되며, 이는 유익한 물질 생산 감소와 해로운 물질 증가로 이어집니다.

이 연구의 **목적**은 인체 마이크로바이옴에서 유래한 펩타이드와 비펩타이드 물질들의 구조와 기능을 깊이 있게 탐구하고, 이를 통해 새로운 유용 물질 발견 및 신약 개발을 촉진하는 데 기여하는 것입니다. 특히 이전 연구에서 다룬 펩타이드 부분을 보완하여 비펩타이드 물질에 대해 자세히 살펴보는 데 중점을 두었습니다.

### 연구 방법

이 연구는 새로운 실험을 진행한 것이 아니라, 기존에 발표된 다양한 과학 논문과 자료들을 종합하고 분석하는 **문헌 조사(review)** 방식으로 진행되었습니다. Google Scholar, Web of Science, PubMed와 같은 과학 데이터베이스에서 핵심 정보를 수집하고, 이를 바탕으로 마이크로바이옴이 생산하는 물질들의 종류와 생리 활성을 정리했습니다.

최근에는 **유전체학(genomics)**, **대사체학(metabolomics)**, **배양체학(culturomics)** 등 다양한 첨단 기법을 활용하여 마이크로바이옴의 물질들을 연구하고 있습니다. 특히 미생물 유전체에서 유용 물질을 만드는 유전자 덩어리(biosynthetic gene clusters, BGCs)를 찾아내고, 이를 통해 어떤 물질이 생산될지 예측하는 **유전체 마이닝(genome mining)** 및 고급 전산 기술이 물질 발견에 활발히 사용되고 있습니다. 이 연구 역시 이러한 최신 연구 동향을 반영하고 있습니다.

### 연구 결과: 어떤 물질들이 발견되었나?

인체 마이크로바이옴을 구성하는 주요 박테리아 그룹(phyla)은 피르미쿠테스(Firmicutes), 박테로이데테스(Bacteroidetes), 악티노박테리아(Actinobacteria), 프로테오박테리아(Proteobacteria), 푸소박테리아(Fusobacteria), 베루코마이크로비아(Verrucomicrobia) 여섯 가지입니다. 이 연구는 특히 앞의 네 가지 주요 그룹에서 발견된 물질들에 대해 상세히 소개합니다.

**1. 피르미쿠테스 (Firmicutes)**

인체 마이크로바이옴의 약 90%를 차지하는 주요 그룹 중 하나로, 가장 다양한 생리 활성 물질을 생산합니다.

*   **비펩타이드:** 이 그룹의 미생물들은 **단쇄지방산(Short-chain fatty acids, SCFAs)**을 주로 생산하며, 이는 우리 건강에 매우 유익한 물질입니다. 또한 락토바실러스(Lactobacillus) 속에서는 강력한 항균 작용을 하는 **로이테린(reuterin)**과 항진균 작용을 하는 **무타노사이클린(mutanocyclin)** 등이 발견되었습니다. 엔테로코쿠스(Enterococcus) 속에서는 항산화 및 항염증 특성을 가진 **유롤리틴 G(urolithin G)**와 다양한 플라보노이드, 테르페노이드, 지방산 등이 확인되었습니다.

*   **펩타이드:** 피르미쿠테스에서 유래한 펩타이드들은 주로 **항균** 특성을 가집니다. 유제품에서 흔히 발견되는 락토코쿠스 락티스(Lactococcus lactis)가 생산하는 **니신(nisin)**은 미국 식품의약국(FDA)의 승인을 받아 식품 보존제로도 사용됩니다. 그 외에도 락토바실러스 속의 가세리신(gassericin)과 플란타리신(plantaricin), 스트렙토코쿠스(Streptococcus) 속의 살리바리신(salivaricin) 등 다양한 항균 펩타이드들이 발견되었습니다. 포도상구균(Staphylococcus) 속에서는 루그두닌(lugdunin)과 같은 독특한 펩타이드 항생제도 발견되었습니다. 이러한 펩타이드들은 현재 항생제 내성 문제의 해결책으로서 큰 관심을 받고 있습니다.

**2. 박테로이데테스 (Bacteroidetes)**

피르미쿠테스와 함께 장내 마이크로바이옴의 대부분을 차지하며, 주로 복잡한 다당류를 분해하는 역할을 합니다.

*   **비펩타이드:** 박테로이데스 프라길리스(Bacteroides fragilis)는 항균 특성이 있는 **콜산(cholic acid)**과 **데옥시콜산(deoxycholic acid)**을 생산하며, 면역 조절 효과가 있는 **α-갈락토실세라마이드(α-galactosylceramide)**와 **프로피온산(propionic acid)**도 생산합니다. 또한 이 그룹에서는 다양한 페닐프로파노이드 유래 물질과 **스핑고지질(sphingolipids)**이 발견되었는데, 스핑고지질은 염증 및 면역 조절에 중요한 역할을 할 수 있습니다.

*   **펩타이드:** 박테로이데스 불가투스(Bacteroides vulgatus)에서 생리 활성 펩타이드인 **콤멘다마이드(commendamide)**가 분리되었으며, 그 외에도 다양한 항균 펩타이드가 보고되었습니다.

**3. 프로테오박테리아 (Proteobacteria)**

다양한 환경에 분포하며, 잠재적인 병원균을 많이 포함하고 있어 이 그룹의 불균형은 질병과 관련되는 경우가 많습니다.

*   **비펩타이드:** 슈도모나스 아에루기노사(Pseudomonas aeruginosa)는 염증을 촉진하는 신호 분자인 **N-(3-oxo-dodecanoyl)-l-homoserine lactone (3-oxo-C12-HSL)**과 독성 물질인 **피오시아닌(pyocyanin)**, 생물막 형성을 돕는 **페나진(phenazine)**을 생산합니다. 클렙시엘라(Klebsiella) 속에서는 병원성 발현에 기여하는 **시데로포어(siderophores)**와 세포 독성 독소인 **틸리발린(tilivalline)**이 발견되었습니다. 엔테로박터(Enterobacter) 속은 감염 및 의료 관련 질병과 관련된 독소 및 요독증 독소를 생산합니다.

*   **펩타이드:** 에스케리키아 콜라이(Escherichia coli)의 특정 종에서 항균 활성을 가진 **미소신(microcins)**이 발견되었습니다.

**4. 악티노박테리아 (Actinobacteria)**

주로 피부와 점막 표면에 존재하며, 장 건강과 면역에 기여하는 유익한 균을 포함합니다.

*   **비펩타이드:** 비피도박테리움(Bifidobacterium) 속은 항산화 특성이 있는 **페닐아세트산(phenylacetic acid)**을 생산합니다. 코리네박테리움(Corynebacterium) 속에서는 호흡기 질환과 관련된 물질들이 발견되었습니다. 로도코쿠스(Rhodococcus) 속은 항균 특성이 있는 **아우라킨 RE(aurachin RE)**와 **휴미마이신(humimycin)**, 시데로포어 등을 생산합니다. 마이코박테리움(Mycobacterium) 속은 결핵 등의 질병과 관련된 지질 물질인 **프티오세롤 다이마이코세로세이트(phthiocerol dimycocerosate)**와 독소인 **미콜락톤 폴리케타이드(mycolactone polyketides)**를 생산합니다. 노카르디아(Nocardia) 속은 항균 및 항종양 특성을 가진 다양한 화합물과 시데로포어를 생산합니다.

*   **펩타이드:** 비피도박테리움 속에서 비피도신(bifidocin) 등 항균 펩타이드가 발견되었습니다.

**5. 진균 (Fungi)**

박테리아보다 수는 적지만 인체 마이크로바이옴의 중요한 구성원이며, 다양한 질병과 관련됩니다.

*   **대사 산물:** 칸디다(Candida) 속은 다른 미생물과의 상호작용에 영향을 미치는 **파르네솔(farnesol)**이나 항진균 작용을 하는 **YM-170320**과 같은 물질을 생산합니다. 아스페르길루스 푸미가투스(Aspergillus fumigatus)와 같은 병원성 진균은 다양한 독성 물질(extrolites)을 생산합니다. 장내 진균 공동체에서 발견된 특정 대사 산물들은 장내 미생물 다양성 및 안정성에 영향을 미치는 것으로 나타났습니다.

이 외에도 식단, 특히 **프리바이오틱스**는 마이크로바이옴이 생산하는 대사 산물에 큰 영향을 미칩니다. 식이 섬유와 같은 프리바이오틱스는 유익균이 발효하여 SCFAs와 같은 유익한 물질을 생산하도록 돕습니다.

### 고찰, 의의 및 시사점

이 연구는 인체 마이크로바이옴이 항균 펩타이드뿐만 아니라 매우 다양한 종류의 비펩타이드 물질을 생산하며, 이들이 우리 몸의 건강과 질병에 복합적으로 영향을 미친다는 것을 보여줍니다.

특히 항생제 내성이 심각한 문제가 되고 있는 상황에서, 마이크로바이옴 유래의 펩타이드 물질들은 새로운 항균제 개발의 강력한 후보군이 될 수 있습니다. 또한 마이크로바이옴이 생산하는 대사 산물들은 개인 맞춤 의학(precision medicine)에서 질병의 바이오마커(생체 표지자)로 활용되거나, 질병 메커니즘 이해, 맞춤형 치료 전략 수립에 중요한 정보를 제공할 수 있습니다.

하지만 인체 마이크로바이옴에는 아직 발견되지 않은 미생물 종과 이들이 생산하는 물질들이 매우 많습니다. 이 물질들을 효율적으로 찾아내고 특성을 규명하기 위해서는 기존의 연구 기술을 더욱 발전시키는 것이 필요합니다. 개인마다 마이크로바이옴 구성이 매우 다양하기 때문에, 이러한 다양성을 고려하여 핵심적인 미생물과 물질을 식별하고 이를 활용한 치료법을 개발하는 것도 중요한 과제입니다.

### 이 연구가 중요한 이유

이 연구는 단순히 마이크로바이옴의 다양한 물질들을 나열하는 것을 넘어, 이들이 우리 건강에 미치는 광범위한 영향을 강조하고 있습니다. 인체 마이크로바이옴은 더 이상 단순히 '몸 안에 사는 세균'이 아니라, 우리 건강을 유지하고 질병을 예방 및 치료하는 데 핵심적인 역할을 하는 '숨겨진 공장'과 같습니다.

이 공장에서 생산되는 다양한 펩타이드와 비펩타이드 물질들을 깊이 이해하는 것은 다음과 같은 점에서 매우 중요합니다.

*   **새로운 의약품 발견:** 항생제 내성 문제를 해결할 새로운 항균 물질이나, 암, 신경 질환, 대사 질환 등 다양한 질병을 치료할 혁신적인 신약을 마이크로바이옴에서 발견할 가능성을 제시합니다.

*   **질병 진단 및 예방:** 특정 물질의 존재나 농도 변화를 통해 질병 발생 가능성을 예측하거나 질병 상태를 진단하는 데 활용될 수 있습니다.

*   **개인 맞춤 건강 관리:** 개인의 마이크로바이옴 특성과 생산하는 물질들을 분석하여 식단 조절, 프로바이오틱스/프리바이오틱스 섭취 등 개인에게 가장 적합한 건강 관리 전략을 수립하는 데 도움을 줄 수 있습니다.

*   **미생물 생태계 이해 증진:** 우리 몸 안의 복잡한 미생물 생태계가 어떻게 상호작용하고 우리 몸과 소통하는지를 이해하는 데 필수적인 정보를 제공합니다.

결론적으로, 이 연구는 인체 마이크로바이옴이 생산하는 물질들의 보고(寶庫)를 탐험하며, 이들이 가진 엄청난 잠재력을 보여줍니다. 앞으로 이러한 물질들에 대한 연구가 더욱 활발해져서, 전 세계 수많은 사람들의 건강을 개선하고 생명을 구하는 획기적인 의학적 발견으로 이어지기를 기대해 봅니다.





출처: @ye._.vely618


금요일, 9월 20, 2024

분변으로 알아낸 신생아들의 장 속 우주 이야기

오늘 논문은 장내미생물 중에 신생아들의 장내미생물 얘기 되겠습니다. 제목은 Primary succession of Bifidobacteria drives pathogen resistance in neonatal microbiota assembly 으로 천여명의 신생아들의 변을 분석해서 신생아들 장내의 미생물 군집의 정착에 따라 아이들의 건강이 어떻게 달라지는지를 확인했다고 합니다. 그 중에서 bifidobacteria에 초점이 맞춰저 있다고 합니다. :)

DOI: 10.1038/s41564-024-01804-9


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인간의 장에는 수많은 미생물이 존재하며, 이들은 우리의 건강에 큰 영향을 미칩니다. 특히, 신생아의 장내 미생물 군집은 처음 형성되는 과정에서 병원균 감염에 대한 저항성을 결정하는 중요한 역할을 합니다.

최근 연구에서는 장내 미생물의 초기 구성을 결정하는 주요 요인들을 확인했습니다. 이 요인들은 산모의 나이, 인종, 출산 방법 등의 임상적 요인과 모유 수유 여부 등의 환경적 요인으로 나눌 수 있습니다. 이러한 요인들은 신생아의 장내 미생물 군집의 다양성과 균형을 결정하며, 이는 장기적으로 건강에 영향을 미칠 수 있습니다.

모유 수유는 신생아의 장내 미생물 군집 형성에 큰 영향을 미치는 것으로 알려져 있습니다. 모유에는 다양한 영양소와 함께 미생물 성장에 필요한 성분이 포함되어 있으며, 모유 수유를 통해 Bifidobacteria가 전달됩니다. Bifidobacteria는 신생아의 장에서 빠르게 증식하여 유해한 세균의 성장을 억제하고, 면역력을 강화하는 데 중요한 역할을 합니다.

연구팀은 2,387개의 분변 샘플을 수집하여 분석했습니다. 이 샘플은 1,288명의 신생아로부터 수집되었으며, 주로 생후 4일, 7일, 21일에 채취되었습니다. 이 데이터를 통해 미생물 군집의 다양성과 균형을 분석하고, Bifidobacteria의 역할을 조사했습니다.

분석 결과, Bifidobacteria는 초기 정착 과정에서 우위를 점하며, 병원균에 대한 저항성을 강화하는 데 중요한 역할을 하는 것으로 나타났습니다. 또한, Bifidobacteria가 풍부한 장내 미생물 군집을 가진 신생아는 그렇지 않은 신생아에 비해 면역력이 강하고, 알레르기나 비만 등의 질환 발생 위험이 낮은 것으로 확인되었습니다.

이 연구는 장내 미생물 군집의 형성과 변화 과정을 이해하는 데 큰 도움을 주었습니다. 또한, 모유 수유의 중요성을 강조하고, 이를 통해 신생아의 건강을 증진할 수 있는 방법을 제시했습니다. 이 연구 결과는 의료 분야에서 활용될 수 있으며, 예를 들어, 신생아의 면역력을 강화하기 위한 프로바이오틱스 개발에 활용될 수 있습니다.

또한, 이 연구는 환경적 요인과 임상적 요인이 장내 미생물 군집에 미치는 영향을 파악함으로써, 개인 맞춤형 건강 관리에도 활용될 수 있을 것으로 기대됩니다.



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## 신생아의 작은 세상, 장내 미생물 이야기

우리 몸속에는 수많은 미생물들이 살고 있습니다. 특히 장 속에는 다양한 종류의 미생물들이 모여 살면서 우리의 건강에 큰 영향을 미치는데, 이를 장내 미생물이라고 합니다. 이 작은 미생물들은 우리가 먹는 음식을 소화하고, 면역 체계를 발달시키며, 심지어 우리의 기분까지 조절하는 중요한 역할을 합니다.

**신생아의 장내 미생물, 어떻게 형성될까요?**

갓 태어난 아기의 장 속은 깨끗한 상태입니다. 하지만 아기가 엄마 젖을 먹고, 주변 환경과 접촉하면서 다양한 미생물들이 아기의 장 속으로 들어오기 시작합니다. 이렇게 들어온 미생물들은 서로 경쟁하고 협력하며 아기에게 고유한 장내 미생물 군집을 형성합니다.

**이 연구에서는 무엇을 밝혀냈나요?**

이번 연구에서는 1,288명의 영국 신생아의 장내 미생물을 분석하여 신생아의 장내 미생물이 어떻게 변화하는지 자세히 살펴보았습니다. 연구팀은 아기의 똥을 분석하여 어떤 종류의 미생물이 살고 있는지 알아내고, 이를 통해 세 가지 유형의 장내 미생물 군집을 발견했습니다.

**세 가지 유형의 장내 미생물 군집?**

* **유형 1:** 비피도박테리움 브레베(B. breve)라는 미생물이 많이 발견된 유형입니다.

* **유형 2:** 비피도박테리움 롱검(B. longum)이라는 미생물이 많이 발견된 유형입니다.

* **유형 3:** 엔테로코쿠스 페칼리스(E. faecalis)라는 미생물이 많이 발견된 유형입니다.

**비피도박테리움이 뭐예요?**

비피도박테리움은 모유 수유를 하는 아기의 장에서 많이 발견되는 유익한 미생물입니다. 이 미생물은 모유에 들어있는 특별한 당 성분(HMOs)을 먹고 자라면서 아기의 면역 체계를 발달시키고, 유해한 세균의 성장을 억제하는 역할을 합니다.

**이 연구 결과의 의미는 무엇일까요?**

이 연구는 신생아의 장내 미생물이 매우 빠르게 변화하며, 비피도박테리움이 신생아의 장 건강에 매우 중요한 역할을 한다는 것을 보여주었습니다. 특히, B. breve와 B. longum은 다른 유해한 세균들과의 경쟁에서 우위를 점하고 아기의 장을 건강하게 유지하는 데 중요한 역할을 하는 것으로 나타났습니다.

**이 연구 결과는 어떻게 활용될 수 있을까요?**

이 연구 결과는 신생아의 건강 문제를 예방하고 치료하는 데 활용될 수 있습니다. 예를 들어, 장내 미생물 불균형으로 인해 발생하는 아토피 피부염이나 알레르기 질환과 같은 질병을 예방하기 위해 프로바이오틱스를 활용한 치료법을 개발하는 데 도움이 될 수 있습니다. 또한, 미숙아나 저체중아와 같이 장내 미생물이 불안정한 아기들에게 맞춤형 영양 관리를 제공하는 데 활용될 수 있습니다.

**마무리**

이 연구는 아기의 장내 미생물이 얼마나 중요한지, 그리고 이를 조절하는 것이 얼마나 중요한지 다시 한번 알려주었습니다. 앞으로도 신생아의 장내 미생물에 대한 연구가 계속되어 아기들이 더욱 건강하게 성장할 수 있도록 돕기를 기대합니다.

**더 궁금한 점이 있다면?**

* **데이터와 분석 방법:** 연구팀은 1,288명의 신생아의 분변 샘플을 채취하여 DNA를 추출하고, 차세대 염기서열 분석 기법을 이용하여 미생물의 유전체 정보를 분석했습니다. 이를 통해 각 샘플에 어떤 종류의 미생물이 얼마나 많이 존재하는지 정확하게 파악할 수 있었습니다.

* **확인한 결과에 대한 의견:** 연구 결과는 신생아의 장내 미생물이 매우 다양하고 개인별 차이가 크다는 것을 보여주었습니다. 또한, 비피도박테리움이 신생아의 장 건강에 중요한 역할을 한다는 기존 연구 결과를 뒷받침하는 결과를 얻었습니다.

* **고찰:** 이 연구는 대규모 코호트 연구를 기반으로 진행되었지만, 인종이나 지역에 따른 차이, 모유 수유 여부 등 다양한 변수의 영향을 고려하지 못한 한계점이 있습니다. 따라서 후속 연구를 통해 이러한 변수들을 통제하고 더욱 정확한 결과를 얻을 필요가 있습니다.

**이 글이 신생아의 장내 미생물에 대한 이해를 돕는데 도움이 되었기를 바랍니다.** 



chatGPT

이 연구는 신생아의 장내 미생물 군집이 형성되는 과정과 그 변화를 설명하고 있습니다. 특히, **Bifidobacterium**이라는 유익한 미생물이 신생아의 장에서 중요한 역할을 한다는 것을 중점적으로 다룹니다. 신생아의 장은 태어날 때는 거의 무균 상태이지만, 출생 후 다양한 미생물에 노출되면서 점차 복잡한 미생물 군집을 형성하게 됩니다. 이 과정에서 어떤 미생물이 먼저 정착하느냐에 따라 신생아의 건강에 중요한 영향을 미칠 수 있습니다.

### 연구 배경

신생아가 태어나면 어머니의 몸과 환경으로부터 여러 미생물에 노출됩니다. 자연분만을 한 아기들은 어머니의 산도와 장에서 비롯된 미생물을 받을 가능성이 높고, 제왕절개로 태어난 아기들은 병원 환경에서 흔히 발견되는 미생물에 더 노출될 수 있습니다. 이러한 초기 미생물 군집이 형성되는 과정은 '초기 승계'라고 하며, 이 초기 승계는 이후 장내 미생물의 구성을 좌우하는 중요한 역할을 합니다.

이 연구는 영국에서 1,288명의 신생아를 대상으로 한 대규모 데이터를 사용하여, 신생아 장내 미생물이 어떻게 형성되는지를 분석했습니다. 신생아의 대변을 주기적으로 수집하여, 그 안에 존재하는 미생물의 유전자 정보를 메타게놈 분석이라는 기술로 확인했습니다. 이 기술은 신생아의 장내에 어떤 미생물이 얼마나 있는지를 고해상도로 분석하는 방법입니다.

### 연구 방법

연구진은 신생아들의 대변 샘플을 여러 차례 수집하여 미생물 군집이 어떻게 변화하는지 추적했습니다. 연구에 사용된 분석 방법은 **메타게놈 분석**으로, 미생물의 유전자를 추출해 그 종류와 양을 확인하는 방식입니다. 이를 통해 신생아 장내 미생물 군집이 초기에는 단순하다가 시간이 지남에 따라 더 복잡해지는 과정을 확인했습니다.

이 연구에서는 특히 **Bifidobacterium**이라는 유익한 미생물이 신생아 장내에서 중요한 역할을 한다는 사실을 밝혀냈습니다. 이 미생물이 우세한 신생아는 병원균이 장에 정착하는 것을 억제하고, 더 건강한 미생물 군집을 형성할 가능성이 높았습니다.

### 주요 결과

1. **세 가지 주요 미생물 군집 상태**: 연구에 따르면, 신생아 장내 미생물 군집은 세 가지 주요 상태로 나눌 수 있었습니다. 이 중 하나는 **Bifidobacterium breve**라는 미생물이 우세한 군집, 다른 하나는 **Bifidobacterium longum**이 우세한 군집, 그리고 **Enterococcus faecalis**라는 병원균이 많은 군집이었습니다.

2. **Bifidobacterium이 우세한 군집의 안정성**: Bifidobacterium이 우세한 군집에서는 미생물 군집이 비교적 안정적으로 형성되었고, 병원균이 장에 침투하는 것을 막는 기능을 했습니다. 특히 모유 수유를 받은 신생아들은 이러한 미생물이 장에 잘 정착했으며, 이는 병원균 저항성과 연관이 깊었습니다.

3. **제왕절개와 병원 환경의 영향**: 제왕절개로 태어난 아기들은 자연분만 아기들보다 병원균에 더 노출되기 쉬웠으며, 이는 장내 미생물 군집의 불안정을 초래할 수 있었습니다. 제왕절개 아기들은 특히 **Enterococcus faecalis**가 우세한 군집을 가질 확률이 높았으며, 이 미생물은 항생제 저항성 유전자를 포함하고 있어 장내 병원균의 성장을 촉진할 수 있습니다.

### 의견 및 고찰

이 연구는 신생아가 태어날 때부터 어떤 미생물에 노출되느냐가 이후 장내 미생물 군집 형성과 건강에 얼마나 중요한 영향을 미치는지를 보여줍니다. 특히 모유 수유가 신생아 장내에 유익한 미생물 군집을 형성하는 데 중요한 역할을 한다는 사실은 모유 수유의 중요성을 다시 한번 상기시켜 줍니다.

또한, 제왕절개 출산이 신생아의 미생물 군집에 미치는 영향을 고려할 때, 병원에서의 감염 관리가 중요하다는 점을 시사합니다. 연구 결과는 병원균에 의한 감염을 줄이기 위해 제왕절개로 태어난 아기에게는 특별한 미생물 관리 전략이 필요할 수 있음을 시사합니다.

### 연구의 의의 및 활용 분야

이 연구 결과는 다양한 분야에서 활용될 수 있습니다. 첫째, 신생아의 장내 미생물 군집을 더 건강하게 형성하기 위한 **프로바이오틱스**나 **프리바이오틱스** 개발에 도움이 될 수 있습니다. 특히 Bifidobacterium이 병원균에 대한 저항성을 높이는 데 중요한 역할을 한다는 사실은, 이러한 유익한 미생물을 신생아에게 제공하는 것이 효과적일 수 있음을 보여줍니다.

둘째, 제왕절개로 태어난 아기들의 건강을 지원하는 새로운 **의료 관리 전략**을 개발하는 데 기여할 수 있습니다. 병원 환경에서 신생아가 접하는 병원균을 줄이기 위한 감염 관리 전략, 또는 모유 수유를 촉진하는 정책이 중요할 수 있습니다.

마지막으로, 이 연구는 인간의 **초기 면역 시스템**과 **미생물의 상호작용**에 대한 이해를 높이는 데 기여합니다. 장내 미생물은 면역 발달에 중요한 역할을 하므로, 이 연구는 미래의 면역 관련 질병 예방 연구에도 중요한 기초 자료가 될 것입니다.

이처럼 신생아 장내 미생물의 형성과 변화에 대한 이해는 신생아 건강 관리, 면역 발달 연구, 그리고 질병 예방 분야에서 중요한 역할을 할 수 있습니다.



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## 신생아 장내 미생물 군집 형성 및 변화 과정

**아기가 태어나는 순간, 엄마의 몸속에서  sterile(무균) 상태였던 아기의 장에는 다양한 미생물들이 자리 잡기 시작합니다. 마치 빈 땅에 여러 종류의 식물들이 들어와 숲을 이루는 것처럼, 아기의 장에도 복잡한 미생물 생태계가 만들어지는 것이죠. 이러한  미생물 군집은 아기의 건강과 면역 체계 발달에 매우 중요한 역할을 합니다.**

### 1. 연구 배경: 장내 미생물, 왜 중요할까요?

* **인간의 장에는 수많은 종류의 미생물이 살고 있으며, 이를 통틀어 장내 미생물이라고 부릅니다.** 마치 인체 내부의 또 다른 장기처럼 여겨질 만큼 그 중요성이 강조되고 있습니다. 

* **특히 신생아 시기의 장내 미생물은 아기의 면역 체계 발달과 성장, 그리고 여러 질병에 대한 감수성에 큰 영향을 미칩니다.** 따라서 신생아 시기에 어떤 미생물이 장에 자리 잡는지, 그리고 그 미생물들이 어떤 변화 과정을 거치는지에 대한 연구는 매우 중요합니다.

### 2. 연구 내용: Bifidobacterium, 장내 미생물의 선구자!

본 연구는 영국에서 1,288명의 신생아를 대상으로 대규모 장기 추적 메타지놈 분석을 수행하여, 신생아 장내 미생물 군집 형성 과정을 자세히 밝혔습니다. 

**2.1. 3가지 군집 유형**: 연구 결과, 신생아의 장내 미생물은 크게 **세 가지 유형**으로 구분되었습니다. 각 유형은 특정 미생물 종이 우세하게 나타나는 것이 특징이며, 이는 마치 특정 식물이 군락을 이루는 것과 유사합니다. 

    * **Bifidobacterium longum (BL) 유형**: 자연분만과 같이 엄마의 산도를 통과하며 미생물을 전달받는 경우, 주로 BL 유형이 형성됩니다.

    * **Bifidobacterium breve (BB) 유형**: BB 유형은 흥미롭게도 분만 방식보다는 산모의 민족성, 특히 아시아인 산모에게서 높게 나타나는 경향을 보였습니다. 이는 특정 HMO (모유 올리고당) 성분과 관련 있는 FUT2 유전자와 관련 있을 가능성이 제기되었습니다. 

    * **Enterococcus faecalis (EF) 유형**: 제왕절개 분만이나 분만 중 항생제 사용과 같이 외부 환경에 노출된 경우, EF 유형이 나타날 가능성이 높았습니다.  EF 유형은 다른 유형에 비해 미생물 다양성이 낮고, 항생제 내성과 관련된 유전자가 풍부하게 나타나는 특징을 보였습니다.

**2.2. Bifidobacterium의 우선적 안착**: 연구진은 BL 유형과 BB 유형에서 공통적으로 Bifidobacterium이라는 미생물이 장내 환경을 지배적으로 장악하는 것을 확인했습니다. 

* **Bifidobacterium은 모유에 풍부한 HMO를 효과적으로 분해하여 에너지원으로 활용할 수 있는 능력을 지니고 있습니다.** 

* **특히 BB 유형을 구성하는 B. breve는 HMO 중에서도 가장 풍부한 성분인 2’-푸코실락토오스 (2’-FL)를 분해할 수 있는 특별한 효소를 가지고 있어, 다른 미생물들보다 경쟁 우위를 가지고 장내에 안정적으로 정착할 수 있습니다.** 

* **반면, EF 유형의 주요 미생물인 E. faecalis는 HMO를 분해하는 능력이 부족하여, Bifidobacterium에 비해 장내 정착력이 떨어지는 것으로 나타났습니다.**

**2.3. 지속적인 영향**: 신생아 시기에 형성된 장내 미생물 군집 유형은 이후 영아기까지도 영향을 미치는 것으로 밝혀졌습니다. 

* 특히 BB 유형의 경우, B. breve가 영아기까지 우세한 미생물 종으로 유지되는 경향을 보였습니다.  

* EF 유형은 시간이 지남에 따라 E. faecalis의 비율이 감소하면서 다른 유형으로 전환되는 경우가 많았지만, 여전히 EF 유형에 노출되었던 신생아들은 영아기까지 E. faecalis를 보유할 가능성이 높게 나타났습니다.

### 3. 연구의 의의: 미래 맞춤형 프로바이오틱스 개발을 위한 초석

본 연구는 신생아 장내 미생물 군집 형성 과정에 대한 중요한 정보들을 제공하며, 이는 **미래의 아기 건강 증진 및 질병 예방을 위한 중요한 지표**가 될 수 있습니다.

* **Bifidobacterium의 중요성**: Bifidobacterium, 특히 **B. breve**가 신생아 장내 미생물 군집 형성과 면역 발달에 중요한 역할을 한다는 것을 다시 한번 확인했습니다. 

* **맞춤형 프로바이오틱스 개발**: 이러한 연구 결과를 바탕으로 **각 신생아의 특성에 맞는 맞춤형 프로바이오틱스 개발**에 활용할 수 있습니다. 예를 들어, 제왕절개로 태어난 아기에게는 Bifidobacterium을 포함한 프로바이오틱스를 투여하여 건강한 장내 환경을 조성하는 데 도움을 줄 수 있습니다.

* **장내 미생물 연구**: 본 연구는 신생아 장내 미생물 군집의 역동적인 변화 과정을 보여주는 중요한 자료이며, 이는 앞으로 더욱 심도 있는 장내 미생물 연구의 기반이 될 것입니다. 


신생아들의 변을 통해서 시간이 지남에 따라 신생아들의 장내에서 어떤 미생들이 우점되는지, 그에 따라 아이들의 건강이 어떻게 변화하는지 확인보는 연구로... 아이들을 위한 범용 Magic bullet을 만드는데 좀 더 가까워 질 수 있을지는 잘 모르겠지만 이번에 천여명정도 자료를 수집했으니 다양한 인종과 환경의 아이들의 장내미생물 조사를 통하면 범용적으로 사용가능한 Magic bullet에 담을 수 있는 대략적인 미생물종과 조성 정보들을 찾아 낼 수 있지 않을까합니다. 성인들한테 쓸 수 있는 Magic bullet은.... 그냥 사기꾼일 확률이 다분히 높지만 영유아를 대상으로 사용 가능한 Magic bullet은 가능하지 않을까하네요



출처: @ye._.vely618


토요일, 11월 21, 2020

Uterine Microbiota의 이해

읽는다 읽는다 하면서 이제서야 정리하는 내용...



microbiota라고 하면 대부문 gut microbiota를 떠올리지만 인체에는 다양한 외부 기관들이 있는바 거기에 각각 독특한 microbiota를 가지고 있다는 사실!!

그중에서도 오늘은 글쓴이가 한때 업무를 보았던 NIPS와 밀접한 자궁내 미생물총에 대해서 리뷰된 논문이 있어서 한번 읽어 보았습니다.

설마 재미가 있을리는.... 
업무와 관련있는 내용을 논문이 나온지 2년이나 지난 지금에서야 읽고 정리하는 역설적인 상황!! 

어쨌거나 논문을 들여다보자면...

일단 리뷰지인만큼 미생물총, 그중에 자궁 미생물 총에 대해서 배경을 설명해주고 있습니다. 1세기 전만해도 자궁은 무균지대라는 가설이 지배적이었다고... 질은 외부세균으로부터 자궁을 보호하는 역할을..  (아니 무슨 말을 하는건지.. 밁칡짉안곩섥는... 사실 먼 훗날 현재는 사실로 받아들이는것들이 헛소리라고 밝혀지는것도 있을테니....)

그래도 최근에는 culture방법을 통해서 저 말도안되는 가설을 밀어내고 있고 현재는 NGS로 다양한 연구를 통해 자궁내 미생물총에 대한 기능에 대해서 알아가고 있습니다.

다양한 연구라 함은 자궁내 미생물총의 차이가 반복적인 유산과 조산등에 대한 원인이라는 연구가 있어 자궁내 미생물총이 host인 여성의 건강, 그리고 직접적으로는 태아의 건강과도 연관되지 않을까 하는 연구입니다.

본 리뷰지에는 10개의 자궁내 미생물총 연구 결과 논문을 소개하고 있는데 개별 연구에서 일관성있는 결과들이 나오지 않아서 본 리뷰 논문 제목처럼 자궁내 미생물총은 우리와 함께하는 파트너(거주자)인지, 어떠한 이유로 자궁으로 들어와서 잠시 머무르는 존재(여행자)인지, 악의적인 목적을 가진 존재(침입자)인지 질문을 하고 있습니다.

일관성이 보이지 않는 개별 연구의 내용들은 IVF 시술을 받은 여성들 사이에서 차이를 본 연구, 별도의 자궁이상이 없다고 판단되나 반복적인 유산 및 착상 실패를 보이는 여성들의 미생물총 차이, 자궁내막증이나 기타 다른 질환으로 자궁 수술을 받아 건강한 삶을 살고 있는 여성과 자궁내막증과 같은 질환을 가지고 있으나 아직 수술전인 여성들과의 미생물총 차이 등등등... 

얼핏보면 좀 차이가 있어보일만한 그룹을 비교를 했는데도 왜 연구마다 결과가 상이 혹은 반대의 결과를 보이는것은 실험방법의 한계, 즉 피험자의 코호트 크기(피험자 수, 논문을 보시면 아시겠지만 30명전후라서..), 시퀀싱의 한계, 먹거리와 같은 차이로 인한 환경의 차이, 샘플링방법... (물론 멋지다고 생각한 연구 디자인도 빠질수 없겠죠)

여튼 그래서 논문저자들은 각 연구의 결과들을 취합하여 다음과 같은 자궁내 미생물에 대해서 설명하고 있습니다.

1. 파트너(거주자)로써의 자궁내 미생물의 역할
 호르몬에따라(월경주기/폐경기전후) 비슷한 미생물 프로파일을 보이는 경향이 존재.

2. 잠시 거쳐가거나(여행자) 기회를 봐서 문제를 일으키는 존재(틈을봐서 돌변하는 침입자)
 수정을 위해 잠시 들어오게되는 미생물들이 있을 수 있음을 확인. 그러나 일부 인과관계는 확인되지 않았으나. 자궁 내막증을 가진 여성의 자궁 미생물 프로파일은 그렇지 않은 여성의 자궁 미생물 프로파일과 차이를 보였음.

3. 이도저도아니고 걍 백해무익한 존재(침입자)
 특정 질병을 가지고 있거나 특정 문제가 있을때 자궁/질에서 우점하고 있는것처럼 보이는 미생물 프로파일 결과가 있음.


결과는 그렇다고 쳐도 다양한 방법과 피험자들을 대상으로 pilot연구가 되어 있으니
우리는 이것을 보고 한걸음 더 나아가면 되지 않을까 합니다.

그리고 gut-brain을 시작으로 다양한 axis가 있는데 이번기회에 gut-organome 중 하나로 gut-vagina axis을 주창하는 기회를...


부록으로 논문에서 언급된 논문들을 SRA에서 확인해 봤는데, 혹시 사용하시려면 한번더 확인해보고 사용하시면 되겠습니다.



논문 SRA번호
Fang et al. (49) PRJEB9626
Moreno et al. (47) PRJNA329174
Walther-Antonio et al. (35) SRP064295
Chen et al. (27) PRJEB16013, PRJEB21098

저자 뒤에 표시된 괄호안 숫자는 논문내 에서 표시되는 reference 번호입니다.







출처: @sana_twice.09