내가 디자인한 (아마도 업체나 primer3에서 디자인된..) 프라미어 서열이 진짜 잘 작동할까? 궁금하신 분들이 있겠죠..
그래서 kent옹께서 우리들과 같은 꼬꼬마들을 위해서 만들어 놓은 사이트가 바로
UCSC In-silico PCR 되겠습니다.
물론 사이트에서 하나씩 할 수도 있고
당근 local 서버에 다운받아서도 할 수 있습니다.
다운로드는 >여기< 로
다운로드 받은 isPcr.zip 파일을 압축 푼 후
>chmod 755 isPcr>./isPcr
하면 내 컴퓨터(운영체제가 윈도우라고는 안했다)에서 실행 가능합니다.
>isPcr <database> <query> < output>database: 그냥 fasta파일의 human genome넣어주면되고query: primer서열이 들어있는 파일인데 3개 컬럼으로 이뤄진 파일이 input으로 사용됩니다.name, forward primer, reverse primer 컬럼 구분은 space나 tab으로 구분해주면되는데..
어떤건지 정확히는 다시 해봐야 알겠네요.. :)
