레이블이 multi-omics인 게시물을 표시합니다. 모든 게시물 표시
레이블이 multi-omics인 게시물을 표시합니다. 모든 게시물 표시

금요일, 9월 06, 2024

인간 노화의 복잡성을 이해하기 위한 다중 오믹스 연구

오늘은 지난달에 노화에 대해서 발표한 연구 내용을 LLM에게 물어보았습니다. 다만 논문 용량이 40M라서 가능한 LLM이 chatGPT와 NotebookLM, 두개밖에 안되었습니다. 물론 gemini는 용량에 제한이 없는데 pdf파일을 잘 못찾아서 이번에는 제외하였습니다.

논문 제목은 Nonlinear dynamics of multi-omics profiles during human aging 이고, 다양한 연령대를 대상으로 연구를 진행하여 결과를 내었습니다. 

DOI: 10.1038/s43587-024-00692-2


chatGPT

### 인간 노화의 복잡성을 이해하기 위한 다중 오믹스 접근법

**연구 배경과 목적**

노화는 심혈관 질환, 당뇨병, 신경퇴행성 질환, 암 등 다양한 인간 질병과 밀접하게 관련된 복잡하고 다면적인 과정입니다. 이러한 연관성을 이해하기 위해서는 노화 과정에서 발생하는 분자적 변화를 파악하는 것이 매우 중요합니다. 기존의 노화 연구는 주로 시간이 지남에 따라 일어나는 선형적 변화를 중심으로 이루어졌습니다. 그러나 나이가 들어감에 따라 나타나는 질병의 진행과 사망 위험은 특정 시점에서 급격히 증가하는 경향이 있어, 분자적 과정에서 비선형적 변화가 일어나고 있음을 시사합니다.

이 연구는 이러한 비선형적 변화를 심층적으로 탐구하기 위해 다중 오믹스 접근법을 활용했습니다. 유전체학, 단백질체학, 대사체학, 미생물군 데이터 등을 포함한 다양한 생물학적 데이터를 분석했으며, 혈액, 대변, 피부, 구강, 비강 스왑 등 다양한 샘플에서 데이터를 수집했습니다. 연구 대상자는 25세에서 75세 사이의 108명으로, 이들을 약 1.7년에서 6.8년까지 추적 관찰했습니다. 연구의 주요 목적은 인간 노화 과정에서 비선형적 변화를 보이는 주요 분자 및 생물학적 경로를 식별하여 노화와 관련된 질병의 잠재적 치료 표적을 파악하는 데 있습니다.

**연구 결과**

이 연구는 노화 과정에서 나타나는 비선형적 분자 변화에 대한 중요한 발견을 제시했습니다. 특히, 44세와 60세 즈음에 분자적 불규칙성이 크게 증가하는 두 개의 주요 시기를 확인했습니다. 이 시기 동안 다음과 같은 특정 분자 및 기능적 경로에서 중요한 변화가 나타났습니다:

1. **면역 조절 및 탄수화물 대사**: 약 60세에 이르러 면역 조절과 탄수화물 대사에서 뚜렷한 변화가 관찰되었습니다. 이는 당뇨병 및 면역 관련 질환에 대한 취약성이 증가할 수 있는 전환 시기를 의미합니다.

2. **심혈관 질환, 지질 및 알코올 대사**: 약 44세에는 심혈관 질환 지표와 함께 지질 및 알코올 대사에서 변화가 나타났습니다. 이는 중년기가 심혈관 질환 및 대사성 질환이 발생할 수 있는 중요한 시기임을 시사합니다.

이 연구 결과는 노화 과정이 단순한 점진적 쇠퇴가 아니라, 복잡하고 비선형적인 분자적 변화가 일어나는 과정임을 보여줍니다.

**인간 건강에의 기여**

이 연구 결과는 인간 건강에 중요한 시사점을 제공합니다. 분자적 변화가 가장 뚜렷하게 나타나는 특정 시기를 식별함으로써, 이 연구는 언제 그리고 어떻게 치료 전략을 개입해야 할지를 파악하는 데 유용한 통찰을 제공합니다. 예를 들어, 특정 연령대에서 면역 기능과 대사에 중요한 변화가 발생한다는 사실은 노화 관련 질병의 위험을 완화하기 위한 맞춤형 치료나 생활습관 개입의 개발에 중요한 기초를 제공합니다.

더 나아가, 노화의 비선형적 동역학을 분자적 수준에서 이해함으로써, 노화 관련 질병의 발병을 예측하는 바이오마커를 식별할 수 있는 가능성이 열립니다. 이를 통해 조기 진단 및 보다 정밀한 개입이 가능해져, 궁극적으로는 개인의 생물학적 특성에 맞춘 개인화된 의학으로 나아가는 길을 열 수 있습니다. 이는 건강수명 연장과 삶의 질 향상에 기여할 것입니다.

결론적으로, 이 연구의 다중 오믹스 접근법은 인간 노화의 복잡하고 비선형적인 특성을 밝혀내며, 건강 개선을 위한 새로운 가능성을 제시합니다.



NotebookLM

## 인간 노화 과정에서 나타나는 비선형적 변화에 대한 다중 오믹스 연구

### 연구 배경 및 목적

**노화는 심혈관 질환, 당뇨병, 신경 퇴행 및 암을 포함한 다양한 질병과 밀접하게 연관된 복잡한 생리적 변화 과정입니다.** 노화의 메커니즘을 이해하고 노화 관련 질병의 치료 표적을 식별하는 것은 건강 수명을 연장하는 데 매우 중요합니다. 기존 연구들은 노화 과정에서의 선형적 변화에 초점을 맞추었지만, **노화 관련 질병의 발병 및 사망 위험은 특정 시점 이후에 가속화되는 경향을 보여 노화 과정에서의 비선형적 분자 변화 연구의 중요성이 부각되고 있습니다.**

본 연구는 **인간 노화 과정에서 나타나는 비선형적 분자 변화의 포괄적인 양상을 탐구하고, 이러한 변화에 관여하는 분자 및 생물학적 경로에 대한 통찰력을 제공하는 것을 목표로 합니다.** 

### 연구 결과 요약

본 연구에서는 25세에서 75세 사이의 108명의 참가자를 대상으로 장기간에 걸쳐 다중 오믹스 프로파일링을 수행했습니다.  참가자들은 평균 1.7년 동안 추적 관찰되었으며, 최대 추적 기간은 6.8년이었습니다.

**연구 결과, 노화 과정에서 분자 마커의 상당한 변화가 약 44세와 60세의 두 주요 시기에 발생하는 것을 확인했습니다.**

* **44세 전후**: 심혈관 질환, 지질 및 알코올 대사 변화와 관련된 분자 및 기능적 경로의 변화가 나타났습니다.

* **60세 전후**: 면역 조절 및 탄수화물 대사와 관련된 분자 및 기능적 경로의 변화가 나타났습니다.

**특히, 분자의 6.6%만이 노화 과정에서 선형적 변화를 보였으며, 81%는 비선형적 패턴을 나타냈습니다.** 이는 **노화가 선형적 과정이 아니며**, 노화 관련 질병의 위험이 특정 연령대에서 급격하게 증가한다는 것을 시사합니다.

**결론:**

이 연구는 인간 노화 과정에서 발생하는 역동적이고 비선형적인 분자적 변화에 대한 귀중한 통찰력을 제공합니다. 연구 결과는 노화가 선형적 과정이 아니며 특정 연령대, 특히 약 40세와 60세에서 발생하는 뚜렷한 분자적 변화가 있음을 강조합니다. 또한 노화에 따라 심혈관 질환, 피부 및 근육 기능 저하, 면역 기능 장애 및 신장 기능 저하를 포함한 다양한 질병의 위험이 비선형적으로 증가한다는 사실이 밝혀졌습니다. 이러한 발견은 노화 과정과 이와 관련된 질병 위험에 대한 이해를 높이는 데 기여합니다.

### 추가 고려 사항

본 연구는 108명의 비교적 작은 표본 크기를 가지고 있으며, 스탠포드 대학교 주변 지역 사회를 대상으로 수행되었다는 제한점을 가지고 있습니다. 따라서 연구 결과를 일반화하기 위해서는 더 큰 규모의 연구가 필요합니다. 또한, 본 연구에서 관찰된 분자적 변화는 동일 개인 내에서의 변화가 아닌 다양한 연령대의 개인들 간의 차이를 나타낸다는 점에 유의해야 합니다. 따라서 개인 내에서의 노화 과정을 정확하게 파악하기 위해서는 장기간에 걸친 추적 연구가 필요합니다.


100여명의 다양한 연령대를 대상으로 조사한 마 40대와 60대 전환기에 각각 차이들이 발견되었다고 하네요. 개인적으로는 40대는무사히(?) 지나갔으니 이제 다가올 60대를 잘 대비해야 할 듯 합니다.

그리고 이 논문의 데이터를 확인할 수 있는 사이트와 github 도 제공하고 있으니 나중에 한번 접속해서 확인하시면 재미있는 것을 발견할 수 있지 않을까합니다. 

자료접근: https://portal.hmpdacc.org/

github: https://github.com/jaspershen-lab/ipop_aging



출처 : @ye._.vely618

토요일, 6월 15, 2024

우주 비행은 우리에게 안전할까?

오늘은 최근에 나온 논문을 한번 가져와봤습니다. 이름하여 Spatial multi-omics of human skin reveals KRAS and inflammatory responses to spaceflight 입니다.

우주에 나갔을 때 과연 우리 몸은 괜찮을까에 대한 단서를 얻을 수 있는, 잘 디자인된 연구이지 않을까 합니다. (aka 돈이 많이 들었을것 같으니깐요)

DOI: 10.1038/s41467-024-48625-2


그래서 오늘도 세 AI에게 물어보았습니다.


gemini

## 우주비행이 인간 피부에 미치는 놀라운 영향: 과학자들이 밝힌 충격적인 사실

**서론**

우주여행은 인류의 오랜 꿈이자 끊임없는 도전입니다. 하지만 우주라는 극한 환경은 인체에 다양한 영향을 미칠 수 있습니다. 특히 피부는 외부 환경으로부터 우리 몸을 보호하는 중요한 역할을 하기 때문에 우주비행 중에 큰 영향을 받을 수 있습니다.

최근 과학자들은 Inspiration4 승무원들의 피부를 연구하여 우주비행이 인간 피부에 미치는 영향을 자세히 밝혀냈습니다. 이 연구 결과는 과거 우리가 생각했던 것보다 훨씬 더 놀라운 사실을 보여주고 있습니다.

**우주비행이 피부에 미치는 영향**

연구 결과에 따르면 우주비행은 인간 피부에 다음과 같은 영향을 미칩니다.

* **염증 반응 증가:** 우주비행 후 모든 피부 영역에서 염증과 관련된 유전자 발현이 크게 증가했습니다. 이는 우주 환경에서 피부가 스트레스를 받고 염증 반응을 일으킨다는 것을 의미합니다.

* **KRAS 신호 활성화:** KRAS는 세포 증식과 분화를 조절하는 중요한 단백질입니다. 연구 결과 우주비행 후 KRAS 신호가 활성화되는 것을 발견했습니다. 이는 피부 세포의 성장과 분화에 영향을 미칠 수 있습니다.

* **상피 장벽 파괴:** 상피 장벽은 피부를 외부 환경으로부터 보호하는 중요한 역할을 합니다. 연구 결과 우주비행 후 상피 장벽이 손상되는 것을 발견했습니다. 이는 피부가 건조하고 민감해지는 원인이 될 수 있습니다.

* **T 세포 이동 및 재생 방해:** T 세포는 면역 체계의 중요한 부분이며 감염으로부터 우리 몸을 보호합니다. 연구 결과 우주비행 후 T 세포의 이동과 재생이 방해되는 것을 발견했습니다. 이는 면역력 저하로 이어질 수 있습니다.

* **피부 미생물 군집 변화:** 피부 표면에는 다양한 미생물이 서식하고 있습니다. 연구 결과 우주비행 후 피부 미생물 군집이 변화하는 것을 발견했습니다. 이는 피부 건강에 영향을 미칠 수 있습니다.

**연구 결과의 중요성**

이 연구 결과는 우주비행이 인간 피부에 미치는 영향에 대한 우리의 이해를 크게 향상시켰습니다. 이러한 지식은 미래 우주 임무를 위한 피부 건강 유지 전략 개발에 중요한 역할을 할 것입니다. 또한 지구상에서 염증, 암, 노화와 같은 피부 문제 치료에 새로운 가능성을 제시합니다.

**블로그 게시글 예시**

**제목:** 우주여행이 피부에 미치는 놀라운 영향: 과학자들이 밝힌 충격적인 사실


clova-x

 우주 비행은 인체에 다양한 영향을 미칠 수 있습니다. 이 중 일부는 체액량 변화, 골밀도 감소, 근육량 감소, 신경계 변화, 면역계 변화, 심리적 영향 등이 있습니다.

우주 비행에서는 중력이 없기 때문에 체액이 상체로 쏠리게 됩니다. 이는 심장과 혈관에 부담을 줄 수 있습니다. 또한, 뼈가 자극을 받지 않아 골밀도가 감소할 수 있으며, 움직임이 제한되기 때문에 근육이 약화되고 근육량이 감소할 수 있습니다.

우주 비행에서는 중력이 없기 때문에 뇌와 척수의 기능이 변화할 수 있습니다. 이는 인지능력과 운동능력에 영향을 미칠 수 있습니다. 또한, 미생물 군집이 변화할 수 있으며, 이는 면역계에 영향을 미칠 수 있습니다.

우주 비행에서는 고립된 환경에서 생활해야 하기 때문에 심리적 스트레스가 발생할 수 있습니다. 이러한 영향들은 우주 비행사들의 건강과 임무 수행에 영향을 미칠 수 있습니다. 따라서 우주 비행사들은 이러한 영향을 최소화하기 위해 다양한 예방 조치와 치료 방법을 적용해야 합니다.

우주 비행이 인체에 미치는 영향을 연구하여 우주 비행 기술을 발전시키는 데도 활용할 수 있습니다. 예를 들어, 우주 비행이 인체에 미치는 영향을 연구하여 우주 비행사들의 건강을 보호하고, 우주 비행 기술을 발전시키는 데 활용할 수 있습니다.

우주 비행은 인류의 꿈이자 미래입니다. 하지만 우주 비행이 인체에 미치는 영향을 고려하여, 우주 비행사들의 건강과 안전을 보호하는 것이 중요합니다. 또한, 우주 비행이 인류에게 가져올 미래를 예측하고, 이를 대비하는 것도 필요합니다.

우주 비행은 인류의 꿈이자 미래입니다. 우리는 우주 비행을 통해 새로운 지식과 기술을 습득하고, 인류의 미래를 개척해 나가야 합니다. 하지만 우주 비행이 인체에 미치는 영향을 고려하여, 우주 비행사들의 건강과 안전을 보호하는 것이 중요합니다.


chatGPT

### 우주 비행이 인체에 미치는 영향: 피부를 중심으로

우주 비행은 인류에게 새로운 도전과 가능성을 제시하지만, 동시에 우리 몸에 다양한 생리학적 변화를 일으킵니다. 최근 연구에서는 우주 비행이 인간 피부에 미치는 영향을 심도 있게 조사하여 중요한 결과를 도출했습니다. 이 글에서는 우주 비행이 인체, 특히 피부에 미치는 영향을 중심으로 살펴보겠습니다.

#### 우주 비행의 전신적 영향

우주 비행은 중력의 부재로 인해 신체의 여러 시스템에 변화를 일으킵니다.

1. **근골격계 변화**:

   - **근육 소실**: 미세 중력 상태에서는 근육 사용이 줄어들어 근육이 위축되고 소실됩니다. 특히 다리 근육에서 이러한 현상이 두드러집니다.

   - **골밀도 감소**: 중력 부재로 뼈에 가해지는 부하가 줄어들어 골밀도가 감소하고 골절 위험이 증가합니다.

2. **심혈관계 변화**:

   - **체액 이동**: 체액이 몸의 상부로 이동하면서 얼굴이 붓고 다리 부종이 감소합니다. 

   - **심혈관 기능 변화**: 심박수, 혈압, 심박출량 등의 변동이 있으며, 동맥 경화가 증가할 수 있습니다.

3. **시력 손실**:

   - 두개내압 증가로 인한 '우주 비행 관련 신경 안과 증후군'이 발생하여 시력 손실을 초래할 수 있습니다.

4. **대사 변화**:

   - 인체의 대사 과정이 변화하여 인슐린 저항성과 같은 대사 장애를 일으킬 수 있습니다.

5. **면역 기능 저하**:

   - 면역 체계의 기능이 약화되어 감염 위험이 증가합니다.

#### 우주 비행의 피부에 미치는 영향

피부는 신체의 주요 보호 장벽으로, 우주 비행의 환경 변화에 민감하게 반응합니다. 최근 연구는 우주 비행이 피부에 미치는 여러 영향을 밝혀냈습니다.

1. **피부 과민성과 자극 증가**:

   - 우주 환경에서 피부는 더욱 민감해지고 쉽게 자극을 받습니다.

2. **섬유 네트워크 희소화**:

   - 피부의 섬유 네트워크가 희소화되어 피부 구조의 탄력성과 강도가 저하될 수 있습니다.

3. **표피 증식과 복구 장애**:

   - 표피 세포의 증식과 복구 과정이 방해받아 상처 치유가 지연될 수 있습니다.

4. **염증 반응**:

   - 우주 비행 후 염증 관련 유전자 발현이 증가하여 피부의 면역 반응이 활발해집니다.

5. **미생물 군집 변화**:

   - 우주 비행 전후 피부 미생물 군집이 변화하여 피부의 면역 반응과 연관된 결과가 나타났습니다.

#### 연구 방법

연구팀은 Inspiration4 우주비행 승무원 4명을 대상으로 비행 전후 피부 생검을 실시했습니다. 다양한 오믹스 기법을 사용하여 유전자 발현, 미생물 및 면역 변화를 분석했습니다. 연구 결과, 우주 비행이 피부의 염증 반응 증가, 섬유 네트워크 변화, 표피 증식 및 복구 장애 등을 일으키는 것으로 나타났습니다.

이 연구는 우주 비행이 피부와 관련된 생물학적 시스템에 미치는 영향을 다각도로 분석하여, 미래의 우주 탐사 임무에서 발생할 수 있는 건강 문제를 예측하고 대비할 수 있는 중요한 기초 자료를 제공합니다. 이러한 연구 결과는 우주 비행의 안전성을 높이고, 장기 우주 탐사에 대한 준비를 도울 수 있을 것입니다.

우주 비행은 인류에게 무한한 가능성을 제공하지만, 동시에 신체에 다양한 도전을 안겨줍니다. 지속적인 연구와 분석을 통해 이러한 도전에 대비하고, 우주 탐사의 미래를 밝힐 수 있기를 기대합니다.


결국 우주를 나가면 지구와 다른 환경이 되다보니 몸이 반응을 하는데, 다시 지구로 귀환하면 정상으로 돌아온다고 합니다. 하지만, 그 정상이라는게 진짜 정상인지.. 단순히 지구라는 환경에 적합하게 적응하는것은 아닌지 궁금하기도 하네요 :)


그리고 gemini가 이번주는 꽤 적극적인 답변을 잘 주는 느낌입니다. 제목도 추천해주고요. 튜닝이 들어갔나? 




출처: @ye._.vely618