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월요일, 2월 10, 2025

All of Us: 병원성 변이 빈도는 조상에 따라 차이가 있습니다.

오늘 가져온 논문은 간만에 다시 돌아온 All of Us의 논문으로 All of Us로 모은 정보를 가지고 확인해 보니 조상에 따라 위함한 변이는 (당연히) 조상에 따라 다르다는 내용입니다. 제목은 The frequency of pathogenic variation in the All of Us cohort reveals ancestry-driven disparities 입니다.



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**All of Us 연구 프로그램: 게놈 의학 구현을 위한 도전과 희망**

**게놈 의학의 잠재력**

게놈 의학은 유전자 정보를 기반으로 개인의 건강 관리를 맞춤형으로 제공하는 새로운 의학 분야입니다. 게놈 의학을 통해 개인의 유전적 특성을 분석하여 질병 예방, 조기 진단, 맞춤형 치료 등을 제공할 수 있습니다. 예를 들어, 유전자 분석을 통해 특정 암이나 심장병에 걸릴 위험이 높은 사람을 미리 알아내고, 이에 맞는 예방 조치를 취할 수 있습니다. 또한, 유전자 분석 결과에 따라 특정 약물이 효과적일지 여부를 판단하고, 환자에게 가장 적합한 약물을 처방할 수 있습니다.

**All of Us 연구 프로그램 소개**

All of Us 연구 프로그램은 미국 국립보건원(NIH)에서 주관하는 대규모 연구 프로그램입니다. 이 프로그램은 미국 전역의 100만 명 이상의 사람들로부터 유전자 정보, 건강 기록, 설문지 데이터를 수집하고 있습니다. 이렇게 수집된 데이터를 활용하여 게놈 의학 연구를 진행하고, 연구 결과를 일반인에게 공개할 예정입니다.

**All of Us 연구 프로그램의 의의**

All of Us 연구 프로그램은 게놈 의학 연구의 새로운 지평을 열 것으로 기대됩니다. 기존의 게놈 연구는 주로 유럽계 인종을 대상으로 진행되었기 때문에, 다른 인종에 대한 연구가 부족했습니다. All of Us 연구 프로그램은 다양한 인종의 참여자들을 대상으로 연구를 진행하기 때문에, 다양한 인종에 대한 게놈 정보를 확보할 수 있습니다. 이는 게놈 의학을 모든 사람에게 보다 공평하게 제공하는 데 도움이 될 것입니다.

또한, All of Us 연구 프로그램은 대규모 데이터를 활용하여 게놈 의학 연구의 정밀도를 높일 수 있습니다. 기존의 연구에서는 소규모 데이터를 활용하기 때문에, 연구 결과의 정확성이 떨어지는 경우가 많았습니다. All of Us 연구 프로그램은 대규모 데이터를 활용하기 때문에, 연구 결과의 정확성을 높일 수 있습니다.

**All of Us 연구 프로그램의 도전 과제**

All of Us 연구 프로그램은 대규모 연구 프로그램이기 때문에, 많은 도전 과제를 안고 있습니다. 첫째, 대규모 데이터를 효과적으로 관리하고 분석하는 것이 필요합니다. 둘째, 참여자들의 프라이버시를 보호하는 것이 중요합니다. 셋째, 연구 결과를 일반인에게 이해하기 쉽게 설명하는 것이 필요합니다.

**All of Us 연구 프로그램의 기대**

All of Us 연구 프로그램은 게놈 의학 연구의 새로운 지평을 열 것으로 기대됩니다. 이 프로그램을 통해 게놈 의학을 모든 사람에게 보다 공평하게 제공하고, 건강 관리의 질을 향상시킬 수 있을 것입니다.



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제목: 정밀의학의 발전을 이끄는 All of Us 연구 프로그램

안녕하세요, 여러분! 오늘은 정밀의학의 발전에 큰 기여를 하고 있는 All of Us 연구 프로그램에 대해 소개해드리려고 합니다.

All of Us 연구 프로그램은 미국 국립보건원(NIH)에서 진행하는 대규모 연구 프로젝트로, 백만 명 이상의 다양한 인종과 배경을 가진 참가자들로부터 유전체, 건강 기록, 전자 의료 기록(EMR), 설문지 등의 방대한 데이터를 수집하고 있습니다. 이렇게 수집된 데이터는 정밀의학 연구에 활용되어 개인 맞춤형 치료법 개발과 질병 예방에 큰 도움을 줄 것으로 기대되고 있습니다.

이 연구 프로그램의 가장 큰 특징은 참가자들의 다양성입니다. 기존의 연구들은 주로 유럽계 백인들을 대상으로 이루어졌지만, All of Us 연구 프로그램은 아프리카계, 라틴계, 아시아계 등 다양한 인종과 배경을 가진 참가자들을 모집하여 유전적 다양성을 최대한 반영하고자 했습니다. 이를 통해 기존 연구에서 놓쳤을 수 있는 질병의 위험 요인을 더욱 정확하게 파악할 수 있을 것으로 기대됩니다.

All of Us 연구 프로그램에서는 세 가지 종류의 데이터를 수집합니다. 첫 번째는 유전체 데이터로, 참가자들의 DNA 염기서열 정보를 담고 있습니다. 두 번째는 건강 기록 데이터로, 참가자들의 과거 병력, 치료 이력, 건강 검진 결과 등을 포함합니다. 세 번째는 전자 의료 기록(EMR)과 설문지 데이터로, 참가자들의 현재 건강 상태와 생활 습관 등을 파악하는 데 사용됩니다.

이렇게 수집된 데이터는 여러 분야의 연구자들에게 공개되어 다양한 연구에 활용되고 있습니다. 최근에는 유럽계, 아프리카계, 라틴계 참가자들의 유전체 데이터를 분석하여 유전적 이상의 빈도를 비교한 연구 결과가 발표되었습니다. 이 연구에 따르면, 유럽계 참가자들에서 가장 높은 비율로 유전적 이상이 발견되었으며, 아프리카계와 라틴계 참가자들에서는 상대적으로 낮은 비율로 발견되었습니다. 이러한 결과는 인종에 따라 유전적 이상의 빈도가 다르다는 것을 보여주며, 이를 고려한 진단 및 치료가 필요하다는 것을 시사합니다.

All of Us 연구 프로그램은 정밀의학의 발전에 큰 기여를 하고 있습니다. 개인의 유전체 정보와 건강 기록을 종합적으로 분석하여 맞춤형 치료법을 개발하고, 질병의 예방과 조기 진단을 가능하게 합니다. 또한, 다양한 인종과 배경을 가진 참가자들의 데이터를 수집함으로써, 인종 간 유전적 차이와 건강 불평등을 해소하는 데에도 큰 도움이 될 것입니다.

지금까지 All of Us 연구 프로그램에 대해 소개해드렸습니다. 이 연구 프로그램은 우리 모두의 건강과 복지에 큰 도움이 될 것이며, 앞으로의 연구 성과가 더욱 기대됩니다. 감사합니다!



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### 블로그 포스트: All of Us 연구 프로그램으로 정밀 의학의 문을 열다

**우리 DNA 속 다양성을 이해하기**

정밀 의학은 개인의 유전 정보, 생활 방식, 환경에 맞춰 질병을 치료하는 방식으로 의료의 패러다임을 바꾸고 있습니다. 이 분야를 선도하는 프로그램 중 하나가 미국 국립보건원(NIH)의 야심찬 프로젝트인 **All of Us 연구 프로그램**입니다. 이 프로그램의 목표는 지금까지 가장 다양하고 포괄적인 생의학 연구 자원을 구축하여, 인구 간 유전적 차이가 건강에 어떤 영향을 미치는지 이해하는 것입니다.

**왜 다양성이 중요한가요?**

지금까지의 대부분의 유전체 연구는 유럽계 인구에 집중되어 있었습니다. 이는 다른 인구 집단에 대한 이해의 부족으로 이어져, 질병의 진단과 치료에서 격차를 초래할 수 있습니다. 특히 "병원성" 유전 변이(질병과 관련된 변이)에 대한 지식은 이러한 연구 결과에서 기인한 경우가 많습니다.

All of Us 연구 프로그램은 이러한 문제를 해결하기 위해 전 세계의 다양한 인구를 대표하는 백만 명 이상의 코호트를 구축하고 있습니다. 이 프로그램은 전장 유전체 분석, 전자의무기록(EHR), 설문조사를 결합하여 다양한 배경, 특히 기존 연구에서 소외된 인구를 포괄하는 데이터를 생성합니다.

**연구는 어떻게 진행되나요?**

연구진은 약 10만 명의 참여자 데이터를 사용해 유방암, 심장병과 같은 질병과 관련된 73개의 유전자를 분석했습니다. 이 과정에서 병원성 유전 변이를 식별하고, 이러한 변이가 각 조상의 유전자 그룹에서 얼마나 자주 나타나는지 조사했습니다. 예를 들어:  

- 유럽계 참여자는 병원성 변이 빈도가 가장 높아 2.26%를 기록했습니다.  

- 아프리카계 참여자는 1.62%,  

- 라틴계/혼합 아메리카계 참여자는 1.32%를 기록했습니다.  

이러한 차이는 특정 유전적 질환이 어떤 집단에서는 더 흔하거나, 더 많이 연구되었음을 보여줍니다. 프로그램은 또한 All of Us 연구자 작업 플랫폼과 같은 첨단 클라우드 컴퓨팅 도구를 사용하여 방대한 데이터를 처리하고 분석합니다.

**연구 결과가 말하는 것**

이번 연구는 몇 가지 중요한 통찰을 제공합니다:  

1. **데이터 대표성 격차**: 기존 데이터베이스는 비유럽계 인구의 데이터가 부족하여 변이 빈도의 차이를 보입니다.  

2. **실질적인 유전적 발견**: 유방암과 고콜레스테롤혈증 같은 질환은 그룹별로 유전적 변이를 보여, 더 정확한 치료 방향을 제시할 수 있습니다.  

3. **새로운 발견**: PKP2 유전자와 같은 몇 가지 변이 차이는 이전에 보고되지 않았으며, 새로운 연구의 길을 열었습니다.

**이 연구가 우리에게 주는 의미**

이 연구는 단순한 과학적 진전 이상으로, 현실 세계에 중요한 영향을 미칩니다. 인구 간 유전적 위험을 이해함으로써 의사들은 더 나은 진단과 치료를 제공할 수 있습니다. 또한 개인이 자신의 유전적 위험을 이해하고 건강 관리를 더 잘할 수 있도록 돕습니다.

더 나아가, 이 프로그램은 유전체 의학 발전의 혜택이 소수의 집단에만 국한되지 않고, 모든 사람에게 공평하게 돌아가도록 기반을 마련하고 있습니다.

**미래를 향해**

All of Us 연구 프로그램은 정밀 의학의 약속을 실현하기 위한 거대한 진보입니다. 다양성과 포용성을 우선시함으로써, 단순히 지식의 공백을 메우는 것을 넘어 모든 사람이 맞춤형 의료의 혜택을 받을 수 있는 미래를 만들어가고 있습니다.

이 연구가 당신의 건강과 미래 세대의 건강에 어떤 영향을 미칠 수 있는지 알아보고, 이러한 여정에 동참하세요. 모두가 더 정밀하고 공평한 의료 시스템을 누리는 날을 위해 함께할 수 있습니다.



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##  모든 사람을 위한 의학: 유전 정보가 건강을 어떻게 바꿀 수 있을까요?

안녕하세요! 오늘은 **All of Us 연구 프로그램**이라는 흥미로운 연구에 대해 소개해드리려고 합니다. 이 연구는 우리의 **유전 정보**가 건강에 미치는 영향을 깊이 있게 탐구하고, 미래 의학의 혁신을 이끌 **정밀 의학** 발전에 크게 기여하고 있습니다.

###  유전 정보: 우리 몸의 설계도

우리 몸은 수많은 세포로 이루어져 있고, 각 세포에는 **DNA**라는 특별한 물질이 들어있습니다. DNA는 마치 우리 몸의 설계도와 같아서, 눈 색깔, 머리카락, 키, 그리고 질병에 대한 취약성까지 다양한 특징을 결정합니다. 

###  All of Us 연구 프로그램: 백만 명의 설계도를 모아서

All of Us 연구 프로그램은 미국 국립보건원(NIH)에서 진행하는 대규모 프로젝트로, **다양한 배경을 가진 백만 명 이상의 사람들로부터 DNA 정보, 건강 기록, 설문 조사 데이터를 수집**하고 있습니다. 이렇게 모은 방대한 데이터를 분석하여 질병 예측, 맞춤형 치료, 건강 불평등 해소 등 다양한 목표를 달성하는 것을 목표로 합니다.

###  다양성이 중요한 이유: 모두를 위한 의학

기존의 유전 정보 연구는 주로 유럽계 백인을 대상으로 진행되어 왔습니다. 하지만 인종, 민족, 지역에 따라 유전 정보는 조금씩 다르기 때문에, 특정 집단에 한반된 연구 결과는 다른 집단에 적용하기 어려울 수 있습니다.

All of Us 연구 프로그램은 **다양한 인종과 민족, 사회경제적 배경을 가진 사람들의 데이터를 수집**함으로써, **모든 사람에게 적용 가능한 정밀 의학**을 실현하고자 합니다.

###  연구 결과: 유전 정보는 조상의 흔적을 담고 있다

이번 연구에서는 98,590명의 유전체 정보를 분석하여, **유전적 조상에 따라 질병 관련 유전 변이의 빈도가 다르게 나타난다는 사실**을 발견했습니다. 예를 들어, 낫鎌状赤血球症과 관련된 유전 변이는 아프리카계 조상을 가진 사람들에게서 훨씬 더 높은 빈도로 나타났습니다. 이는 유전 정보가 우리 조상의 역사와 환경에 대한 정보를 담고 있음을 보여주는 흥미로운 결과입니다. 

###  미래의 의학: 개인 맞춤형 질병 예방과 치료

All of Us 연구 프로그램은 **정밀 의학 시대를 앞당기는 중요한 발걸음**입니다. 앞으로 더 많은 사람들의 데이터가 모이고 분석 기술이 발전함에 따라, 개인의 유전 정보, 생활 습관, 환경 등을 종합적으로 고려한 **맞춤형 질병 예방 및 치료**가 가능하게 될 것입니다. 

예를 들어, 유전적으로 심혈관 질환 위험이 높은 사람은 생활 습관 개선과 정기적인 검진을 통해 질병을 예방할 수 있고, 특정 유전 변이를 가진 암 환자는 그 변이에 효과적인 표적 치료제를 처방받아 치료 효과를 높일 수 있습니다. 

All of Us 연구 프로그램은 **모든 사람들이 자신의 유전 정보를 이해하고 건강 관리에 활용할 수 있는 미래**를 만들어가는 데 기여할 것입니다.



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## 서론

정밀의학은 개인의 유전적 특성, 생활 습관, 환경 요인 등을 고려하여 맞춤형 의료 서비스를 제공하는 것을 의미합니다. 대규모 바이오뱅크인 All of Us 연구 프로젝트는 정밀의학 발전에 중요한 역할을 합니다. All of Us 워크벤치는 참여자의 유전체 정보와 전자 의료 기록, 설문 조사 응답 등 풍부한 데이터를 제공하여, 유전적 요인과 질병의 연관성을 파악하고 이를 토대로 맞춤형 의료 서비스를 개발할 수 있게 해줍니다 [1].

All of Us 연구 프로그램은 정밀의학 발전을 위해 다수의 연구자들이 협력하여 진행하는 대규모 프로젝트입니다. 이 프로그램은 참여자들이 제공한 다양한 데이터를 활용하여 질병의 유전적 요인을 규명하고, 이를 바탕으로 맞춤형 치료 및 예방 서비스를 개발하는 것을 목적으로 하고 있습니다 [2][3]. 이를 통해 국민 건강 증진에 기여할 것으로 기대됩니다.

## 데이터 수집 과정

All of Us 연구 프로그램은 다양한 유형의 데이터를 수집하고 있습니다. 유전체 데이터로는 참여자의 전장유전체 염기서열 분석 결과와 수천 개의 질병 관련 유전자 변이 정보가 포함됩니다. 이를 통해 유전적 요인과 건강 상태의 관계를 규명할 수 있습니다.

임상 및 건강 데이터로는 참여자의 전자 의무 기록, 즉 진단, 치료, 투약, 혈압, 키, 몸무게 등의 정보가 수집됩니다. 또한 생활 습관, 행동, 병력 등에 대한 자세한 설문 조사 응답 데이터도 포함됩니다.

인구통계학적 및 사회경제적 데이터로는 나이, 성별, 인종, 민족, 교육 수준, 소득, 가구 구성 등의 정보가 수집됩니다. 이를 통해 건강 격차를 이해하고 참여자 집단의 다양성을 확보할 수 있습니다.

참여자 모집은 전국 규모의 의료기관 네트워크와 직접 지원을 통해 이루어지고 있습니다. 이를 통해 기존 생물의학 연구에서 소외되었던 다양한 집단의 사람들도 참여할 수 있도록 하고 있습니다.

개인정보 보호와 데이터 보안을 위해 식별 코드 삭제, 인구통계학적 범주 일반화, 날짜 무작위 변경 등의 데이터 변환 작업을 수행하고 있습니다. 또한 OMOP 공통 데이터 모델에 맞춰 데이터를 구조화하여 관리하고 있습니다. 참여자들은 서면 동의서를 작성하였으며, 이 연구는 All of Us 연구 프로그램의 IRB 승인을 받았습니다.

## 연구 결과 및 활용

All of Us 연구 프로그램은 다양한 데이터를 활용하여 정밀의학 발전에 중요한 성과를 거두고 있습니다. 유전체, 임상, 인구통계학적 정보 등 다양한 데이터를 수집하여 분석한 결과, 인종 및 민족적 배경에 따라 특정 질병 관련 병원성 유전 변이의 빈도에 차이가 있음을 발견했습니다. 

예를 들어, 아프리카계 참여자 집단에서 유방암, 가족성 고콜레스테롤혈증, 확장성 심근병증 등과 관련된 유전자의 병원성 변이 비율이 유럽계 참여자 집단에 비해 유의미하게 더 높게 나타났습니다. 이는 유전체 연구에서 다양한 인구집단의 대표성을 확보하는 것이 중요하며, 유럽계 집단 중심의 기존 연구로는 질병 위험 요인을 충분히 파악하기 어렵다는 점을 보여줍니다 [1][17].

또한 All of Us 프로그램은 전자 건강기록과 설문 데이터를 활용하여 특정 질병이 있는 참여자 집단을 선별하고, 이 집단에서 관련 유전자의 병원성 변이 비율이 전체 코호트에 비해 유의미하게 높다는 것을 확인했습니다. 이는 All of Us 데이터셋이 질병의 유전적 요인을 규명하고 맞춤형 치료 및 예방 전략을 수립하는 데 활용될 수 있음을 시사합니다 [21].

이처럼 All of Us 연구 프로그램의 성과는 유전체 연구에서 다양성의 중요성을 보여주고, 대규모 다차원 데이터셋이 정밀의학 발전에 기여할 수 있음을 입증하고 있습니다. 향후 이 프로그램이 지속적으로 성장하고 확장된다면, 건강과 질병의 유전적 기전에 대한 새로운 통찰을 제공하여 더욱 개인맞춤형이고 효과적인 의료 솔루션 개발에 기여할 것으로 기대됩니다 [16][41].

## 의의 및 전망

대규모 바이오뱅크 연구의 중요성

대규모 바이오뱅크인 All of Us 연구 프로그램은 정밀의학 발전을 위해 매우 중요한 역할을 하고 있습니다. 이 프로그램은 다양한 인구집단의 유전체, 건강 기록, 설문 데이터를 수집하고 있어, 정밀의학 실현을 위한 핵심 데이터 리소스 역할을 하고 있습니다 [1][2].

이렇게 구축된 대규모 다양성 데이터셋은 기존 유전체 연구에서 소외되었던 집단에 대한 유전 지식의 격차를 해소할 수 있을 것입니다. 또한 유전체 변이에 대한 기능 연구와 정밀한 변이 해석을 가속화할 수 있을 것으로 기대됩니다 [53].

정밀의학 발전을 통한 국민 건강 증진 기대

이를 통해 정밀의학 분야의 발전이 기대되며, 맞춤형 예방과 치료법 개발로 국민 건강 증진에도 기여할 수 있을 것입니다. 유전체 정보와 다양한 건강 데이터를 바탕으로 질병의 유전적 요인을 규명하고, 이를 토대로 개인별 특성에 맞는 의료 서비스를 제공할 수 있게 될 것입니다 [21][41].

향후 발전 방향 및 과제

향후에는 더욱 다양한 배경의 참여자를 확보하고, 변이 해석과 병리적 영향에 대한 이해를 높이기 위한 지속적인 노력이 필요할 것입니다. 특정 인구집단에 편중된 유전체 지식을 해소하고, 소수 집단 출신 변이에 대한 기능 연구를 강화하는 것이 중요할 것입니다 [53].

## 결론

All of Us 연구 프로그램은 다양한 인구집단의 유전체, 건강 정보 등을 활용하여 질병의 유전적 요인을 규명하고, 이를 토대로 맞춤형 치료 및 예방 서비스 개발에 기여하고 있습니다. 특히 기존 연구에서 소외되었던 집단의 유전적 특성을 포함한 대규모 다양성 데이터셋은 정밀의학 발전에 매우 중요한 역할을 할 것으로 기대됩니다. 향후 All of Us 연구가 지속되고 확장되기 위해서는 국민들의 관심과 지원이 필요할 것입니다. [1][21] 


이번에 질문을 좀 더 다양하게 넣어보니 중간 중간에 이 논문의 내용과 상관없는 내용들이 들어가는 경우도 있네요. 역사기록 같이 학습으로 hallucination을 줄일 수 있는 것은 가능한데 전문적인 연구분야를 물어보는 경우 질문자의 프롬프트로 환각을 유도 할 수 있는 것 같습니다.

질문자의 잘못이다! 로 볼것이냐, 아니면 AI가 이것을 바로잡아줘야지! 그렇지만 쓸모가 역시 많다는 건 맞다는 :)



출처: @ye._.vely618