Lee Gir Won

RDP 이름에서 똭 느껴지지 않으십니까? Ribosomal Database Project 일반 fasta/gb 자료가 있고 trainset 데이터가 있습니다. Bacteria unalign seq ( fa , gb ) Archaea un...

블로그에 쓰는 내용이 16S rRNA에 많이 집중되고 있긴하죠? ㅎㅎ 하는일이 이거다보니.. :) 여튼 오늘은 16S rRNA와 시퀀싱플랫폼에 대해서 잠시 이야기 하도록 하겠습니다. 최근 16S rRNA sequencing의 최강자 454가 ...

근래 microbiome데이터를 다루면서 16s rRNA db 사용에 대해서 확인을 하고자 데이터가 꽤나 많은 그리고 non-academic의 경우 fee도 지불하는 silva를 qiime의 default db인 greengene과 한번 비교를 해...