Lee Gir Won

QIIME2가 출시된지도... 5년 밖에 안됐군요.  꽤 된줄알았는데.. 여튼 오늘은 QIIME2 내부에 있는 classifier에 대한 논문이 있어 gemini에게 한번 읽혀봤습니다. 논문 제목은 " Optimizing taxonomic c...

요즘 QIIME2를 뒤적이고 있는 차에 쓰임이 많아 보이는 논문이 하나 있어서 투적해봅니다. (물론 greengene2만큼일련지는...) Trimming conditions for DADA2 analysis in QIIME2 platform doi: ...

qiime을 한번 실행시켜 봤습니다. 저는 완벽한 ubuntu 시스템이 아닌 윈도우에서 지원하는 linux subsystem에서 ubuntu 18.04 LTS를 설치해서 사용 하고 있습니다. 그래서 약간 이글을 보시는 분들과 환경이 다소 차이가...

지난번 qiime2 파헤치기 에 이어 이번에는 설치편!! WSL을 이용하여 우분투 18.04 LTS에 설치하는것처럼 흉내를 내보겠습니다. 윈도우 10에서 WSL을 활성화시키고 Ubuntu를 설치하면 되겠습니다. 자세한 내용은 > 여기 ...

간만에 qiime2도 간만에 공부하려고 docs 를 한번 읽어보는 겸해서 정리도 같이? :) 그럼  qiime2 가 무엇이냐 우리 롭 훃님께서 만든 microbiome분석 파이프라인, 아니 파이프라인을 뛰어넘어 토탈 분석 패키지(?)이라고 할 ...

QIIME2  출시(된지는 한달여정도... 지났지만..) 설치만 해두려고 qiime2 설치하다가 환경 설정이 꼬였는지 쓰고있던 qiime 1이 작동안해서 멘붕이 왔다는건 비밀;;; 빼고는 아직까지는 호감인 녀석! 여튼 이번 qiime2 출시...