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토요일, 9월 14, 2024
미지의 세계가 열리고 있다
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오늘은 바다의 미생물을 조사한 논문을 가져와봤습니다. 제목은 Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting 입니다. 기존에 NCBI, EBI, JGI 등에 업로드되어 공개...
화요일, 7월 30, 2024
미생물의 기능을 어디까지 알아낼 수 있을까?
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오늘은 23년도 3월에 출판된 딥러닝 방법을 이용한 미생물 기능에 대한 논문 인 Comprehensive Functional Annotation of Metagenomes and Microbial Genomes Using a Deep Learning...
수요일, 11월 08, 2023
이제는 전체 16S rRNA 서열을 봐야하지 하지 않을까? 하는 얘기
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마이크로바이옴 분석을 할 때 매번 나오는 얘기로 16S rRNA에서 V3-V4 영역만으로 괜찮겠냐, full 16S rRNA봐야하는거 아니냐? whole sequencing해야하는거 아니냐 라는 내용의 논문이 있엇 한번 가져와봤씁니다. 2019년에 ...
금요일, 8월 11, 2023
16S rRNA에서 V3/4와 V4/5는 대체 얼마나 다르지?
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정확히 얘기하자면 북극해의 해양 생태계의 미생물 군집을 연구할 때는 16S rRNA의 어느 variable region을 사용하는게 좋을까? 되겠습니다. Comparison of Two 16S rRNA Primers (V3–V4 and V4–V5) f...
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