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수요일, 9월 20, 2023

cnvkit 설치 방법

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간만에 프로그램 설치 기록 하나 남겨 봅니다. 설치할 tool은 Copy Number Variant 탐지에 대명사 중 하나인 CNVKit입니다. 참조할 사이트는 당연히 공식 cnvkit github 고요  첫번째 방법은 conda를 이용한 방법! ...
일요일, 4월 17, 2022

pip를 이용한 패키지 설치 그리고 삭제

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하도 잘 까먹어서.... python3 -m pip install --user <package name> python3 -m pip uninstall <package name> 그렇다고 합니다. ps. 요즘에 cutadapt를 잘...
일요일, 5월 03, 2020

Long Read Assembler 설치 작업 로그

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오랜만에 작업 로그용 글입니다. :) Long Read(aka Nanopore)를 위한 assembler의 설치에 대한 로그로... 모 그렇게 자주 사용 될일이 없을것 같지만.. 그래도.. root권한 또는 sudo권한이 없는 상황을 가정하고 ...
일요일, 12월 01, 2019

qiime2 설치편

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지난번 qiime2 파헤치기 에 이어 이번에는 설치편!! WSL을 이용하여 우분투 18.04 LTS에 설치하는것처럼 흉내를 내보겠습니다. 윈도우 10에서 WSL을 활성화시키고 Ubuntu를 설치하면 되겠습니다. 자세한 내용은 > 여기 ...
월요일, 4월 23, 2012

Velvet과 Oases 설치

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Velvet 다운로드 $tar zxf velvet_1.2.03.tgz $cd velvet_1.2.03 $make default 설정으로 설치하는 경우 그냥 make하면 되지만.. K-mer값을 큰 값으로 사용하고자 하는 경우나 multi-...
금요일, 3월 23, 2012

Eclipse Plugin 설치

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(지금은 또 어떻게 얼마나 많이 변했을지 모르는 Eclipse.... ;; ) Eclipse 사용시 사용하고자 하는 plugin을 설치할 일이 있을 것이다 웬만하면 [HELP] - [Software Updates]에서 해결 가능하다. 그러나...