Lee Gir Won

어이쿠... 기억속에 잊혀져 있던 database가 우리 곁으로 다시 돌아왔네요 옛날에 metagenome 한번 해봤으면 썼었던 바로 그 db, greengene이 버전업 해서 greengene2으로 아래 논문으로 돌아왔습니다. Greengenes2 ...

Microbiome분석을 시작하면서 많이 보게되는 DB가 두개 있습니다. GG와 Silva입니다. 오늘은 그중에 GG즉 greengene 자료를 받아 보겠습니다. greengene 공식 사이트는 > 여기 <입니다. (잘 안들어...

블로그에 쓰는 내용이 16S rRNA에 많이 집중되고 있긴하죠? ㅎㅎ 하는일이 이거다보니.. :) 여튼 오늘은 16S rRNA와 시퀀싱플랫폼에 대해서 잠시 이야기 하도록 하겠습니다. 최근 16S rRNA sequencing의 최강자 454가 ...

근래 microbiome데이터를 다루면서 16s rRNA db 사용에 대해서 확인을 하고자 데이터가 꽤나 많은 그리고 non-academic의 경우 fee도 지불하는 silva를 qiime의 default db인 greengene과 한번 비교를 해...