Lee Gir-Won (Lee Gil-Won)

오늘은 2010년도에 나왔던 논문으로 RNA-Seq으로 기존에 annotation되지 않았던 transcript와 isoform을 구별해 낼 수 있고, 그 발현량도 측정할 수 있는 방법에 대해서 알려주는 논문되겠습니다. 제목은 Transcript as...

이번 글은 Align하는 명령어 편! 되겠습니다. HISAT2 $ ~/hisat2/hisat2 -p num_thread -x /path/to/reference_index --known-splicesite-infile /path/to/splic...

cufflinks Hompage 오오오오오 아예 새롭게 업데이트 한줄 알았는데 그건 아니고 github로 옮기시면서 내용도 업데이트 했는지 프로토콜 클릭 했는데... 프로토콜은 자연 규칙/규약으로 슈슝~  orz 그래 잘 나와있긴 하다...

Warning: BAM header too large File TopHat - cufflinks 조합으로 RNAseq을 분석하는 분들 중에서 과연 얼마나 접해보셨을까 하는데요.. 혹 수백,수천개의 chr을 가진 genome을 분석하시는 분께서...