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금요일, 10월 27, 2023
롱리드 시퀀싱을 쓰지 않을 이유가 있는가?
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이번 논문은 제가 참여한 논문입니다.. 흠흠.. 이름하여 Two long read-based genome assembly and annotation of polyploidy woody plants, Hibiscus syriacus L. using Pa...
일요일, 5월 03, 2020
Long Read Assembler 설치 작업 로그
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오랜만에 작업 로그용 글입니다. :) Long Read(aka Nanopore)를 위한 assembler의 설치에 대한 로그로... 모 그렇게 자주 사용 될일이 없을것 같지만.. 그래도.. root권한 또는 sudo권한이 없는 상황을 가정하고 ...
일요일, 4월 26, 2020
Benchmarking of long-read assemblers for prokaryote whole genome sequencing
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나노포어는 현존하는 시퀀서중에 가장 긴 서열을 뽑아내는 시퀀서임에는 그 누구도 부인하지 못할것입니다. 근데.. 생산된 리드의 각 base의 phred score 를 보자면.. 왜 갑자기 눈에서 물이나오는 이유는 왜때문일까요? (그렇지만 저는 de-n...
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