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금요일, 8월 15, 2025
WGS를 분석하는데 저렴하면서도 빠르게 할 수 없을까? UK Biobank에서 시도해보았습니다.
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오늘은 UK 바이오뱅크에서 관상동맥질환에 대해서 연구하는데 기존 플랫폼에서보다 저렴하고 빠르게 분석했다는 내용에 대해서 알아보겠습니다. 오늘 얘기는 관상동맥 질환에서 유의미한 Loci를 찾았다라기 보다는 관상동맥 질환과 관련된 Loci를 찾는데 사용한...
월요일, 8월 11, 2025
UK 바이오뱅크, 49만명의 WGS에서 무엇을 알아내었나
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오늘은 지난주에 오픈된 따끈따끈한 논문을 가져와봤습니다. 제목은 Whole-genome sequencing of 490,640 UK Biobank participants 으로 UK Biobank에서 지금까지 모은 49만명에 대해서 무엇을 확인하였는지...
목요일, 9월 12, 2024
텔로미어 길이!! 중요할까 안중요할까?
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오늘은 UK Biobank에서 수집된 WGS 데이터를 가지고 텔로미어를 조사한 연구를 가져왔습니다. 제목은 Genetic architecture of telomere length in 462,666 UK Biobank whole-genome seque...
토요일, 8월 24, 2024
WGS, 고형암 정밀의료의 새로운 지평을 열다
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오늘도 WGS 관련된 내용의 논문을 가져와봤습니다. 제목은 Clinical application of whole-genome sequencing of solid tumors for precision oncology 로 카이스트의 주영석교수님이 창업하...
목요일, 8월 22, 2024
소아암 환자에게 희망을 주는 WGS 검사
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오늘은 WGS의 효용성에 대한 논문을 가져와봤습니다. 포스팅 하는 내용들에 사실 큰 흐름은 없습니다. 그때 그때 제 맘대로 많이 찾아지는 논문들을 중심으로 올리고 있다 보니 그때 그때 마음대로 이니깐 그냥 편하게 클릭하시면 됩니다. 오늘 논문 제목은 ...
화요일, 7월 30, 2024
미생물의 기능을 어디까지 알아낼 수 있을까?
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오늘은 23년도 3월에 출판된 딥러닝 방법을 이용한 미생물 기능에 대한 논문 인 Comprehensive Functional Annotation of Metagenomes and Microbial Genomes Using a Deep Learning...
목요일, 4월 04, 2024
병원 내 감염을 NGS로 검사하겠다는데 과연 저렴할까?
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오늘은 지난 3월 말에 genomeweb에 소개된 논문을 가져와 봤습니다. 기사링크: Sequencing Surveillance Improves Outbreak Detection in Hospital at 'Affordable' Cos...
일요일, 2월 11, 2024
WGS 데이터를 활용하여 어떤 방법이 환자에게 보다 효과적인지 확인해보자
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바다 건너 영국에서 진행하고 있는 WGS를 활용한 암환자들에 대한 치료 기회에 대한 내용에 대한 논문을 한번 bar..아니 gemini에게 물어봤습니다. 논문 제목은 " Insights for precision oncology from the...
화요일, 8월 29, 2023
SAM-TB, 주인공은 나야나
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결핵은 참 끊임없이 인류를 괴롭혀오는 감염병균 하나입니다. 더구나 이 녀석이 악랄한 이유는 누구에게나 동일하게 감염되는것이 아닌 개발도상국이나 저소득구간에 있는 생활환경이 그리 좋지 않은 나라나 가정에 더 잘 발병한다는 것입니다. 선진국, 다른 말로 ...
토요일, 12월 05, 2020
WGS는 과연 의료비용을 낮출수 있을까
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Rapid whole-genome sequencing decreases infant morbidity and cost of hospitalization 본 논문은 WGS이 의료 비용 절감과 환우의 치료에 대해 긍정적인 결과에 대한 내용을 담고 있는데 ...
화요일, 9월 22, 2020
8개의 variant caller 통합 도구
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2018년 WGS이나 WES 혹은 Target Seq을 한 후 변이를 확인 할 때 으레 GATK를 사용하는 우리들에게 감사하게도 여러개(정확히는 8개)의 변이 caller 결과를 통합해서 확인 할 수 있는 논문이 발표되었습니다. 진짜 감사할지 이름만 ...
일요일, 11월 10, 2019
저쪽집이 좋지만 우리집도 잘해요, 시퀀싱
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가능하면 일주일에 하나씩은 업데이트 하려고 했는데 여윽시.. 그건 어려운것 같네요 ㅎㅎ 그래도 되는대로 논문읽고 일주일에 한번씩 업데이트 하는걸로 :) 오늘은 금년 6월달에 남중국과학대학에서 Scientific reports에 투고한 논문 되...
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