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토요일, 10월 26, 2024

ACMG 및 AMP의 염기서열 변이 해석 지침, 2015년 버전

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오늘 ACMG/AMP 가이드라인의 바이블 Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the America...
화요일, 10월 22, 2024

AlphaFold 3, 생물학의 새로운 혁신

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알파폴드 세번째 시리즈 AlphaFold3 논문입니다. 제목은 Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold 3 입니다. DOI: 10.1038/s41586-024...
일요일, 10월 20, 2024

단백질의 비밀을 밝혀주는 AI 등장

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오늘은 알파폴드의 2번째 논문 알파미스센스에 대한 논문되겠습니다. Accurate proteome-wide missense variant effect prediction with AlphaMissense  이 논문은 23년도에 출반된 논문으로 금년인 ...
금요일, 10월 18, 2024

Alpha Fold, 진짜의 등장

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오늘은 이번 노벨화학상을 받은 DeepMind사가 개발한 알파폴드 논문에 대해서 시리즈로 LLM에게 물어보았습니다. :) 첫번째 논문으로 Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold 되겠...
수요일, 10월 16, 2024

COVID-19를 더 빠르고 정확하게 진단하기위한 PCR 프라이머 디자인 방법

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오늘은 국내 연구진에 의해서 고안된 COVID-19의 진단 프라이머 디자인 방법에 대한 논문을 가져와봤습니다. 논문 제목은 Identification of conserved regions from 230,163 SARS-CoV-2 genomes and...
월요일, 10월 14, 2024

기계학습 모델을 활용한 약물 재사용

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오늘은 drug repurposing, drug repositioning에 대한 내용을 가져와 봤습니다. 제목은 A foundation model for clinician-centered drug repurposing 입니다. DOI: 10.1038...
토요일, 10월 12, 2024

변이 조합으로 질병 예측하기

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24년도 노벨상에서 AI의 위상이 높아졌기에 2019년에 나왔었던 기계학습 논문 하나 슬쩍 가져와봤습니다. Predicting disease-causing variant combinations 입니다. DOI: 10.1073/pnas.18156011...
금요일, 10월 11, 2024

개인프로젝트 -DAA 계산하기-

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오늘은 지난번까지 모은 주식 정보를 활용해서 DAA 전략 을 계산하는 파이썬 스크립트를 작성해보도록 하겠습니다. 물론 우리의 chatGPT가 작성하였습니다. DAA전략과, DAA에서 사용하는 모멘텀 스코어에 대해서 설명해주고, 파이썬 스크립트를 작성해...
목요일, 10월 10, 2024

단백질 언어 모델을 통한 모든 가능한 질병 변이 예측

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오늘은 변이가 질병에 미치는 영향을 예측하는 내용의 논문을 가져와봤습니다. 제목은 Genome-wide prediction of disease variant effects with a deep protein language model 으로, 비슷한 ...
화요일, 10월 08, 2024

식이요법과 장내 미생물의 복잡 미묘한 관계에 대해서 알아보자

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오늘은 식이요법과 장내미생물과의 관계에 대해서 알아본 2021년 논문을 한번 가져와봤습니다. The complexities of the diet-microbiome relationship: advances and perspectives 으로장내미생물...
금요일, 10월 04, 2024

암 정복을 향한 Big Step, MSK-IMPACT

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하브리다이제이션 캡쳐 방식의 패널의 바이블 MSK-IMPACT에 대한 논문 가져와봤습니다. Memorial Sloan Kettering-Integrated Mutation Profiling of Actionable Cancer Targets (MSK-...
목요일, 10월 03, 2024

개인프로젝트 -주식정보를 모아보자-

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이전에 파이썬 모듈인 yfinance 를 사용한 파이썬 스크립트를 github에 업로드한 적이 있었는데.. 오늘은 살짝 업데이트를 해보았습니다. 기존에는 스크립트를 실행하기 전에 주식정보의 업데이트 기간을 직접 수정했었는데 이번에는 sqlite3에 저...
수요일, 10월 02, 2024

AI 기반 병리학 진단 도우미의 등장, PathChat!!

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오늘은 AI기반 병리학 진단 도우미인 PathChat를 개발한 논문을 들고와봤습니다. 논문은 A multimodal generative AI copilot for human pathology 이고, 오늘 포스트의 제목은 chatGPT가 뽑아줬습니다....