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월요일, 2월 02, 2026

scTour – 단일세포 유전체 데이터로 세포의 시간 여행을 추적하는 새로운 AI 도구

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chatGPT이후 딥러닝이나 AI는 일반 회사들 뿐만 아니라 연구에서도 이제는 없어서는 안될 도구가 되었고 오늘 논문도 그 중 하나라고 생각됩니다. 기존의 RNA-seq은 아무리 잘 샘플링한다고 하더라도 세포들이 homogeneou하지 못하다는 문제가...
금요일, 11월 07, 2025

RNA-seq 분석 할 때 어떤 정규화 방법이 가장 믿을 수 있을까?

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비슷한 논문을 한번 올렸던것 같은데 오늘은 예전에 RNA-seq 분석 시 사용했었던 정규화 방법들간에 어떤 방법이 왜곡이 덜한지, 어떤 방법을 사용했을 때 나은지에 대해서 비교 분석한 내용되겠습니다. 제목은 A comprehensive evaluati...
금요일, 10월 31, 2025

DESeq, RNA-seq 데이터를 더 정확하게 분석해보자.

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이전에 나왔었던 논문으로 RNA-seq 데이터에서 유전자의 발현차를 분석하는 방법에 대한 내용으로 Differential expression analysis for sequence count data 이라는 제목의 논문 되겠습니다. RNA-seq 데이...
월요일, 10월 20, 2025

지금까지 알려지지 않았던 transcripts와 isoform을 찾아보도록 하겠습니다

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오늘은 2010년도에 나왔던 논문으로 RNA-Seq으로 기존에 annotation되지 않았던 transcript와 isoform을 구별해 낼 수 있고, 그 발현량도 측정할 수 있는 방법에 대해서 알려주는 논문되겠습니다. 제목은 Transcript as...
수요일, 10월 15, 2025

RNA-seq을 사용해서 다양한 종이 섞여 있는 샘플을 분석 할 수 있을까?

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오늘은 RNA-seq을 이용해서 여러 종을 분석하는 방법에 대해서 얘기한 논문을 가지고왔습니다. 보통 기주체와 병원체간의 연구에 많이 사용하는 방법으로 Non-Human에서 많이 사용하는데 사람을 연구할 때도 많이 사용하긴 합니다. 사람의 경우는 보통...