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금요일, 10월 25, 2019

간만에 denovo RNA-Seq 해보기 -유전자구조예측편-

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denovo RNA-Seq를 사용해서 조립을 했다면 조립된 서열들은 어떤 유전자인지 궁금해 지겠쥬? 안 궁금하면 그냥 끝! 하고 서열을 NCBI에 fastq파일 디파짓하고 Bye さようなら하면 그냥 남 좋은일 하는 겁니다. (나는 대인배다 ...
월요일, 10월 29, 2018

Microbiome Database를 만들어볼까? -ChunLab편-

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간만에 Microbiome DB 관련 글을 올립니다! 그래봤자 또 다운로드하자 되겠습니다. :) 오늘은 국내 microbiom 기업중 가장 기술력을 가지고 있는 업체인 chunlab의 DB 되겠습니다. 이 DB의 경우 당연히 fee를 내셔야...
일요일, 9월 09, 2018

Microbiome Database를 만들어볼까? -NCBI편 2-

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지난 시간에 이곳 에서 자료를 받아 봤습니다. 오늘은 또 다른 ncbi 자료를 받아 볼겁니다. ※지겹다고요? 제가 그랬잖아요? 당분간은 맨날 다운 받을 거라고 ㅋ 빨라야 추석 이후에야 무엇인가 하지 않을까 기대합니다. 지난번에는 ncbi에...
수요일, 8월 29, 2018

Microbiome Database를 만들어 볼까?

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Microbiome분석을 위해서 여기저기 기웃거려봤다면 여러가지 16S rRNA 데이터베이스가 있다는것을 아실겁니다. 보통 microbiome분석에 입문해서 사용하는 것이라면 대게 처음 분석하는 tool에따라 결정되는데 우리 롭횽님의 qiim...