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월요일, 2월 17, 2025
한국인의 유전적 변이를 알아보자: Long read로
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오늘은 충남대에서 교직생활을 하고 있으신 김준 교수님께서 출판하신 논문을 가져와봤습니다. 제 기억으로는 랜선친구인거로 기억하는데.... 여튼 3명의 한국인의 서열을 Long read로 시퀀싱해서 이것저것 한번 확인해보셨다고 하네요 제목은 Highl...
수요일, 3월 13, 2024
Long-read 시대의 정렬 알고리즘
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사실 아직 Long-read 시대라고 하기에는 전세계 적으로 생산되는 시퀀싱 데이터의 비율로 보면 꼬꼬마이긴 하나 그래도 비용이나 지금까지의 축적된 자료 활용이라는 몇몇 점들을 제외하면 짧은 애들시대는 조만간 저물지 않을까 합니다. 물론 짧은 애들 또...
일요일, 11월 12, 2023
Long Read Sequencing을 전적으로 믿으셔야 합니다.
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항상 느끼는것이지만 사람들은 익숙한것에 익숙하다는... 물론 이 글을 쓰는 본인도 별반 차이 없다는게 현실 그럼에도 불구하고 세상에는 익숙한것을 거부하고 한 걸음 나아가는 분들이 있어서 발전한다는... 오늘은 유전체분야에서 다들 익숙한 짧은길이의 시퀀...
일요일, 11월 07, 2021
HLA를 빠르고 정확하게 할 수 없을까
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그래서 나노포어가 준비했습니다. 절대적으로 빠른 건지, 정확도의 수준은 정확히 모르겠으나 일단 샘플당 $80되겠습니다. 물론 이게 재료비값인지 소비자가인지는..... 아마 본인들이 했을때 가격인듯.... (일반 소비자가 이 가격에 가능할지는 모르겠네요...
일요일, 5월 03, 2020
Long Read Assembler 설치 작업 로그
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오랜만에 작업 로그용 글입니다. :) Long Read(aka Nanopore)를 위한 assembler의 설치에 대한 로그로... 모 그렇게 자주 사용 될일이 없을것 같지만.. 그래도.. root권한 또는 sudo권한이 없는 상황을 가정하고 ...
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