Lee Gir Won

오늘은 지난주에 오픈된 따끈따끈한 논문을 가져와봤습니다. 제목은 Whole-genome sequencing of 490,640 UK Biobank participants 으로 UK Biobank에서 지금까지 모은 49만명에 대해서 무엇을 확인하였는지...

간만에 비침습적 산전 검사, NIPT/NIPS 논문을 가져와봤습니다. 제목은 Performance of cell-free DNA sequencing-based non-invasive prenatal testing: experience on 36,456...

오늘은 최근에 공개된 일루미나의 DRAGEN에 대한 논문이 있어서 가져와봤습니다. Comprehensive genome analysis and variant detection at scale using DRAGEN 입니다. DOI: 10.1038/s...

오늘은 microbiome작업에서 많이 사용되는 DADA2에 대해서 한번 돌아보도록 하겠습니다. 제가 micriobiome 작업을 했을때 qiime1을 가지고 가내수공업으로 만들 때여서 사실 당시 나왔었던 최신 tool은 잘 몰랐었습니다.  많은 시간...

23년에 효모를 사용해서 여러 플랫폼 데이터의 어셈블리 성능을 테스트한 논문이 있어서 한번 가져와봤습니다. 제목은  A practical comparison of the next-generation sequencing platform and assem...

이전 포스팅 에서는 Ion torrent 데이터에 대해서 알아보았으니 이번에는 일루미나 데이터는 과연 괜찮은지 한번 알아보도록 하겠습니다. 그건 그렇고 이전 포스팅하고 꽤 오랜만에 하네요;; Insight into biases and sequencin...

Evaluation of Nanopore sequencing for Mycobacterium tuberculosis drug susceptibility testing and outbreak investigation: a genomic analysis ...

가능하면 일주일에 하나씩은 업데이트 하려고 했는데 여윽시.. 그건 어려운것 같네요 ㅎㅎ 그래도 되는대로 논문읽고 일주일에 한번씩 업데이트 하는걸로 :) 오늘은 금년 6월달에 남중국과학대학에서 Scientific reports에 투고한 논문 되...

이번글은 그냥 둘러보다가 알게된 일루미나에서 새로 나온듯한 Library Kit에 대해서 한번 알아보겠습니다. 모 나온지는 1-2년된듯한 라이브러리 Kit같습니다. 일루미나 라이브러리에 TruSeq이라는 라이브러리 킷외에 Nexte...

오늘 페북에 내 스팸 메일 제외하고 가장 핫한 이슈는 일루미나가 새로운 NGS기계를 내놓았고 그걸 마크로젠이 냉큼 구매했다는 이야기... >Illumina Sequencing System Spec< 물량으로는 일루미나는 때려잡...

"진정 우리꺼는 여러분들에게 좋으면 좋지 해를 안끼친다는.... " - PacBio 본사 시니어 연구원느님의 발표 그렇게해도 PacBio는 정이 안간다는 ㅎㅎ Illumima/ Life Tech.는 "우리거 좋...

Illumina Sequencing에서 사용되는 Adapter중 TruSeq (분석할때 받는 데이터들이 다 요녀석으로 되어 있어서...) DNA/RNA Adapter Sequence를 확인해서 확인해봤습니다. ㅎㅎ Type ...