Lee Gir-Won (Lee Gil-Won)

snp annotation에 빈번히 사용되는 snpEff ( snpSift는 난 모르겠고 ) snpEff에서도 나름 최신의 genome 정보를 제공하고 있지만 내가 de novo진행한것은?? (제가 곰팽이 de novo들을 많이하다보니.. ㅋ...

요즘 de novo를 다루는 관계로 assembly 후 gene prediction 할 때 지난번에 포스팅 했던 maker를 사용 하는 일이 빈번하다. maker 결과 중 gff3 type (이 gff/gtf 파일의 형식이.. 버전마다 상이...

Metazoa 중 기타등등 Name (Ensembl) Total Gene Exon / Gene Total Transcript Exon (bp) ...

Ensembl에서 제공하는 Fungi의 gtf 정보를 사용하여 Summary 해보았습니다. 2주전부터 올릴려고 하고 있었는데 bug 및 계산 착오로 인해서 몇번 수정하느라 늦었습니다. 조만간 업데이트 할 예정입니다. :) ...