Lee Gir-Won (Lee Gil-Won)

블로그에 쓰는 내용이 16S rRNA에 많이 집중되고 있긴하죠? ㅎㅎ 하는일이 이거다보니.. :) 여튼 오늘은 16S rRNA와 시퀀싱플랫폼에 대해서 잠시 이야기 하도록 하겠습니다. 최근 16S rRNA sequencing의 최강자 454가 ...

아.... 이제서야 지난번에 언급했던 NGS QC Toolkit을 사용해 봤습니다. :) 라이브러리와 perl 모듈을 잘 설치해주면 큰 문제없이 잘 돌아가는것을 확인했고 multi-thread로 실행하는 경우 음.. 빠르더라구요 ㅎㅎ 시간...

아.... 딱히 인연이 없던 454 파일을 작업할 기회가 생겨서.. 다음과 같이 스크립트를 좀 작성했습니다. 454에서 제공하는 Data analysis를 이용하지 않아서 좀 거시기합니다. (Homopolymer trimming은 제공하지 ...