Microbiome Database를 만들어 볼까? -GG편-

Microbiome분석을 시작하면서 많이 보게되는 DB가 두개 있습니다.
GG와 Silva입니다.

오늘은 그중에 GG즉 greengene 자료를 받아 보겠습니다.

greengene 공식 사이트는 >여기<입니다.
(잘 안들어가지는 특징이 있습니다.)

공식 greengenes 사이트의 다운로드 페이지를 가면 2013년 5월자 자료가 마지막으로 나옵니다.

근데 롭훃님의 qiime 사이트를 돌아다니다보면
2013년 8월 자료를 득템 할 수 있습니다.
>그곳링크<

위의 2013년 5월 자료와 8월 자료가 얼마나 차이가 날지는
저도 잘 모르겠습니다.

무엇을 받던 도찐개찐 ;)

아니면 이번 기회에 한번 비교 해볼까요?
- 2013년 5월과 2013년 8월 자료는 rep_set 99_otus 기준으로 동일할 것으로 보입니다.
모 그냥 쓰고 싶은거 쓰시면됩니다. (2018년 9월 8일 업데이트)

출처 JYP