Thursday, December 29, 2016

SILVAngs

QIIME2이후 새로운 녀석이 나타났다!!

silvangs음.. 왠지 
MG-RAST 대항마로 나온듯

MG-RAST야 분석 파이프라인만 제공하는것에 반해
silvangs의 경우 막강한 16S rRNA DB를 탑재하고 있으니...




그리고 silvangs 뒤에는 de.NBI (German Network for Bioinformatics Infrastructure)가 든든히 버티고 있는중 좋은 피드백이면 반영해주지 않을까? 하는 생각이..

그리고 silvangs도 일단은 credit으로 운영중 가입하면 300k주고 시작하는데
과금 방법이 분석횟수인지 분석에 필요한 스텝기준인지 아직
안사용해봐서 잘 모르겠다능.. :)

여튼 단점은 rDNA용 커뮤니티 분석이라는것이 한계

WGS가 플랫폼으로 나오면 대박일듯...  물론 WGS이 나오기에는 아직
넘어야할 산이 좀 있으니...
불안불안한 MG-RAST에 이어 web 기반 분석 플랫폼이 나와준것에 박수를..

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