Saturday, March 19, 2016

InterProScan Error를 대하는 방법

근래 interproscan을 돌리는데
어떤 옵션은 문제없이 작업이 진행되는데
어떤 옵션은 작업중에 주구장창 에러만 뱉어내서
내가 무엇을 잘못하는지 어리둥절하고 있었는데 은근 쉬운 문제였다는...

우선 제가 하는 작업은

1) interproscan.sh -i input.fa -appl pfam -f tsv
2) interproscan.sh -i input.fa -goterms -f tsv

1)번 command는 문제업이 계속 잘 진행
2)번 command는 미친듯이 자바에러를... ㅠ.ㅜ

그런데 역시나 그렇듯이
에러를 자세히 보면 해결할 수 있다는 :)
(문제속에 답이 있다는 드립은 아니고;; )

제가 겪은 오류의 문제는 hostname 설정만 해주면 된다는 사실
이유는 -iprlookup 때문인데.. Host를 찾을 수 없어서 쉰나게 에러를(아이 씬나~ )
그래서 /etc/hosts에 127.0.0.1에 그냥 알아서 잘 추가해주면 된답니다.

interproscan 돌리실때 에러난다고 속상해하지 마시고
에러를 잘 확인하시면 그 속에 길이 있을수 있습니다.
ps. 세그먼트 폴트가 난다면 그냥 때려치우세요..

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