Thursday, January 16, 2014

FASTA-Reader Warning

BLAST+의 makeblastdb를 사용하여
blast용 db를 만들고자 할 때
항상 에러없이 잘 만들어지지 않을 수 있다.
거기다 다음과 같은
Error: (1431.1) FASTA-Reader: Warning: FASTA-Reader: Ignoring FASTA modifier(s) found because the input was not expected to have any.

내맘에 안드니깐 무시하고 만든다
라는  에러를 내놓을때는.....

db를 만들고자 하는 fasta파일 각 서열의 header를 간단하게 바꿔보는것도 나쁘지 않은 방법일듯... :)

왜 header를 수정해줘야 하는가?
본인이 header 수정해줘서 정상적으로 blastdb를 만들었으니깐요? :)

1 comment:

Peter Cock said...

I think this is a new bug in BLAST+ 2.2.29,
see my blog post for details.